13 个问题

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• 有40个样本的基因型（重测序结果）、表型数据。可以做什么分析？

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  2024-03-01 11:38
• 30 533个品种先根据盐浓度下发芽率，初步在盐胁迫下挑选120个具有不同发芽时间的品种（不发芽的品种忽略，会导致出现重复表型），然后进一步进行详细表型分析（增加测量性状，如根长、芽长、光谱性状），然后做GWAS关联。

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  2024-03-01 09:57
• 如果是基于已知的两个遗传位点，用GWAS分方法的目的是研究这两个位点随时间序列的跟踪，处于这样的目的40个品种够吗，出于这样的目的的话对品种数量有要求吗？

  0/704

  2024-03-01 09:56
• 10 我现在有公共数据库其中500＋种子，自己测了这种品种的一些表型，要做GWAS分析的话，请问老师，是通过下载fastq文件，自己组装拼接，然后比对到参考基因组上，然后获得这500个品种的VCF文件，然后进行GWAS分析吗？

  1/1020

  2024-01-28 11:27
• https://snp-seek.irri.org/_download.zul从这个网站下载全基因组测序文件，进行GWAS分析，下载哪几个啊

  0/746

  2024-01-26 22:26
• https://snp-seek.irri.org/_download.zul从这个网站下载全基因组测序文件，进行GWAS分析，下载哪几个啊

  0/817

  2024-01-26 22:24
• 如何在水稻3k中下载不同品种的基因组数据，用于发现某品种中是否存在某个基因

  0/509

  2024-01-26 16:25
• 10 请问，做GWAS能用来找小miRNA，小RNA吗？怎么定位小RNA呢？

  1/916

  2024-01-01 07:05
• 请问，做GWAS能用来小miRNA，小RNA吗？怎么定位小RNA呢？

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  2024-01-01 07:04
• 可以利用重测序的结果做表型预测模型吗?(模型构建数据仅基于重测序结果做)

  0/910

  2023-11-21 16:56