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10 个问题
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我想请教一下16s高级扩增子分析中的,微生物共存网络的问题,在“确定物种间存在相互作用关系的阈值,将相关性R矩阵内不符合的数据转换为0”这步中,按照视频中给的代码进行操作后报错,原因是矩阵中有缺失值,请问这个缺失值如何处理,把他如何赋值为0?
1/338
2024-10-29 09:53
请问老师这个LDA图中的other为什莫会出现呢,如何去除,直接在图里截掉,这样可不可以呢
1/477
2024-10-13 11:32
问题1:这是我按照咱们视频里的方法做的Lefse,但它没有上面的小写英文字母,a,b,c,d,等的图例,请问如何添加呢,我看发表的文章中都是有图例的,如何改成第二张图这样呢,右上角标有细菌名字的图例。问题2:第三图中有other,请问这个直接在特征标里面更改吗,删掉注释为other的,这样可以吗,请老师解答,谢谢!
1/508
2024-09-25 22:45
3
我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析,输入了51个样本,但是最后就剩下了35个样本,如图所示,请问是那一步出现错误了,是 数据有问题还是写的参数有问题
0/463
2024-09-05 09:51
物种注释 16S 出现killed
2/672
2024-09-01 15:07
我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析,输入了51个样本,但是最后就剩下了35个样本,如图所示,请问是那一步出现错误了,是 数据有问题还是写的参数有问题
1/478
2024-08-31 20:24
3
#16S 分析 deblur的方法应用时报错,如下图,前面的数据是严格按照视频进行的,请老师解答
1/594
2024-08-31 14:33
5
###16S/18S 方法1:dada2 数据质量过滤,合并,去嵌合,去引物一步完成。这个步骤代码报错,请老师帮我看一下这个问题,之前有帖子也有这个问题,说是建议下载咱们课程提供的docker镜像,我就是下载的咱们课程的docker镜像,但还是出现了这个问题,请老师解答,谢谢!
0/490
2024-08-30 20:31
我的分析内容是16s分析肠道菌群,我是按照咱们课程里的步骤进行的,但是source env.sh 这个命令输入后出现这个界面,请问如何解决
2/559
2024-07-12 20:12
docker pull omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 #下载镜像报错,请问这个怎么解决
1/642
2024-07-04 09:18
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