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GWAS分析的教程中06.impute的beagle填充出现问题
vcftools --gzvcf all.varFilter.vcf.gz --recode --recode-INFO-all --stdout --maf 0.05 --max-missing 0.9 --minDP 2 --maxDP 1000 \ --minQ 30 --minGQ 0 --min-alleles 2 --max-alleles 2 --remove-indels |gzip - > clean.vcf.gz 这条命令的--min-alleles 2 --max-alleles 2可以把多等位...
回答于 3天前
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omicsclass/pan-genome:v1.1镜像OrthoFinder.py报错
老师，结果出来了，谢谢老师，这个问题好像可以通过修改源代码解决，我再去修改试试，如果不能解决就算了，目前不影响后续分析
回答于 2024-11-15 20:47
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动植物泛基因组分析实操课程资料问题
老师，我是用的omicsclass/pan-genome:v1.0镜像，是课程资料里面pip.sh里面的要求的镜像，也是课程中用到的镜像，应该是课程发的资料里面没有更新说明。那老师，如果我想要更新后的镜像和资料，应该怎么获取？还有01.prepare_data 文件夹的内容我应该怎么获取？
回答于 2024-11-14 16:33