发起提问 · 2025-02-12 17:25 老师,在泛基因集构建时JCVI的比对,出现以下错误
发起提问 · 2025-02-12 11:50 老师,我正在执行泛基因及构建的12-30行的指令;视频中data数据中为gff的后缀,我的数据是gff3的,把他后缀改成gff重新上传一遍在执行这条指令吗?
登录 · 2025-02-12 09:47
回答问题 · 2025-02-11 15:25 hmmsearch --domtblout ./${ind}.WRKY_hmmerOut.txt --cut_tc ./WRKY.hmm ./${ind}.gene.pep.fasta;;我有两个结构域,需要如何更改呢?
发起提问 · 2025-02-11 11:51 hmmsearch --domtblout ./${ind}.WRKY_hmmerOut.txt --cut_tc ./WRKY.hmm ./${ind}.gene.pep.fasta;;我有两个结构域,需要如何更改呢?
发起提问 · 2025-02-11 10:10 老师,为什么cds和pep提取不出来?提取出来是0
签到 · 2025-02-11 08:50
登录 · 2025-02-11 08:50
发起提问 · 2025-02-10 16:44 #提取cds 用基因的id,作为序列的id;;1.这条指令如何修改,我想保留第一个pbr013511.1,这条指令只能保留中间部分 2.提取完cds和pep后,>DAnjou后面的内容,没有基因ID,ANQ为他的gff3文件 3.同样也是提取完cds和pe
回答问题 · 2025-02-10 15:34 如何确保.fa和gff3文件的染色体编号一致?手动修改吗;以下是两个基因组的gff和fa