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老师您好,最近在分析基因家族结构的时候遇到了问题。用视频中get_gene_exon_from_gff.pl脚本提取CDS信息时文件为空(参考基因组gff文件只有CDS信息),之后手动提取基因家族序列信息形成gff文件,用TBtools作图也出现了问题,不知道是什么原因?麻烦老师帮我看看呢?
1/4516
2019-04-25 10:59
5
大家好呀,我在验证基因家族的时候,Pfam显示是几乎都是含有相关结构域的,而在SMART里检验居然一大半都显示no match,有人知道是怎么回事吗???
4/5920
2019-04-10 23:09
老师好,我想请问一下在绘制基因家族 exon–intron structure 时如果参考基因组GFF文件里没有exon和UTR信息,只有mRNA和CDS的话怎么办呢?
3/4161
2019-04-01 10:08
5
老师您好,我在circos作图时,显示基因基因数目超出最大值怎么办呢?max_link要怎么设置呀?
1/3207
2019-03-16 22:23
请问一下用circos画基因组共线性图时,genome.blocklink.txt这个文件是怎么来的呀(和MADS.link.txt一样吗)?
1/2769
2019-03-14 16:59
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