singularity shell 交互式运行,加环境变量试试: export PATH=/biosoft/miniconda/envs/picrust2/bin/:$PATH
回答于 2022-11-17 11:36
singularity 里面没法激活环境; 你可以试试用命令的绝对路径运行,试一试 例如: singularity exec /share/singularity_images/ampliseq-q2_v1.4.sif /biosoft/miniconda/envs/picrust2/bin/picrust2_pipeline.py 这样 conda 那条激活环境的命令不用运行了; 其他关于 picrust2 的命令也一样加绝对路径运行 这个...
回答于 2022-11-16 23:49
电脑内存不够,系统自动杀死了; docker 内存:https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2022-11-14 20:40
不知道你电脑内存多少,docker流程运行至少得4G内存吧 你电电脑内存太少了,docker无法启动
回答于 2022-11-14 14:57
这个你需要添加别的谋定才行;sed 默认搜索第一个;并替换; 如果你ID最后没有其他信息,你可以这样: sed 's/\.1\n/\n/' file.txt
回答于 2022-11-14 10:57