omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
13659金币数
76780 经验值
419个粉丝
主页被访问 72596 次

3850 个回答

0 赞同

LD热图绘制问题

你检查你的VCF文件,这个区域有SNP吗? 或者这个区域太小了,你扩大区域试试的;

回答于 2022-11-01 12:08

0 赞同

做用于GWAS的全体的LD decay

你再看看课程理解, LDdecay和GWAS关联的位点没关系的; 只是总体看一下群体的LD连锁情况;

回答于 2022-11-01 12:07

0 赞同

做bsa的时候遇见报错需要怎么解决

没用过bcftools,建议用一下 GATK,我们 有相应的课程:https://zzw.xet.tech/s/1VQOjQ

回答于 2022-10-31 11:37

0 赞同

cg开头的甲基化探针用R语言如何转化为gene symbol

得有探针对应的表格 才可以转换

回答于 2022-10-31 11:35

0 赞同

与基因组分析相关的报班费用可以开正式发票吗

可以的,其他详情可以加微信 532812110 沟通

回答于 2022-10-31 11:35

0 赞同

PASA组装转录本时候报错,既不能创建也不能删除数据库

这个应该是 以前运行过PASA,又重新运行,数据库名字又相同,不能删除和创建; 解决办法1: 重启mysql数据库,把对应的mysql目录里面的所有数据data,log 等文件夹都删除,创建新的mysql容器; https://stackoverflow.com/questions/31229807/cant-drop-database-nor-create-database 原因分析:https://cloud.tencen...

回答于 2022-10-25 09:39

0 赞同

perl脚本去除重复的hmmer搜索的转录本ID为一行,且结果ID是蛋白...

你这个比较麻烦,蛋白ID和mRNA ID 不是一致的,导致脚本找不到对应的蛋白序列; 因为我的脚本认为 mRNAID和  cds pep 序列的ID一致;

回答于 2022-10-24 12:02

0 赞同

我想问下我在可视化的时候,部分窗口(点)展示不完全(只展示半...

这个是ggplot出图的,不影响结果就行; 可以手动用AI 打开PDF修改

回答于 2022-10-21 21:35

0 赞同

关于共享文件夹的问题

在linux系统,以点开头的文件,ls 默认不显示; 需要显示的话 需要加 -a 参数 linux基础不好建议学习课程linux基础课,里面都有讲解:https://zzw.xet.tech/s/17gwqZ

回答于 2022-10-21 21:33

0 赞同

老师,请问在fst和pi联合选择分析的时候,使用群体遗传进化分析...

这里的两行没有设置对,你检查一下:

回答于 2022-10-21 21:29