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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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关于在DOCKER中分析基因家族的motif

在基因家族docker镜像中meme已经添加到环境变量中,最左边 直接用meme 即可,不要加路径;

回答于 2022-08-18 09:17

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基因家族鉴定所用的基因ID与转录组基因ID不一致

采用同一套基因组,也就是把你的转录组分析换成你基因家族分析的基因组重新分析一下,就一致了; 

回答于 2022-08-17 17:46

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BSA分析课程中reseq-demo raz gz在哪个参考资料下载

课程PPT的第一页有下载方法,你仔细看看的;

回答于 2022-08-17 17:43

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合并gvcf时程序终止

不知道你运行的命令,可能是输入文件格式哪里有问题吧

回答于 2022-08-17 09:36

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treemix中按照课程操作cat w.sh,提示没有这个文件

你需要下载 课程资料,把课程资料放到windows的这个目录中才行; 打开文件之前,ls -l  查看一下当前目录是否有文件; docker 基础和linux基础需要学习一下才行: docker基础课:https://zzw.h5.xeknow.com/s/3Rcvt0 linux基础课:https://zzw.h5.xeknow.com/s/17gwqZ

回答于 2022-08-17 09:34

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psmc分析群体历史的时候,参考基因组ref.fa要怎么获取

参考基因组可以到ensembl JGI 等数据库下载物种的参考基因组 https://www.omicsclass.com/article/58

回答于 2022-08-17 09:31

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老师,您好,在用qiime2 运行dada2 时,报错

软件安装问题, 建议用我们的的docker镜像,里面的软件已经安装好了; 

回答于 2022-08-17 09:28

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老师您好,在KAKS分析时duplication_gene.out导出为空怎么解决呢...

你可以手动用excel筛选一下; 可能你的里面本身就没有符合要求的串联重复基因对;

回答于 2022-08-15 09:52

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在进行基因结构分析时,原GFF文件里有UTR信息,但是提取出来的文...

可以 ,但是  绘图就没有UTR展示了; 

回答于 2022-08-12 17:49

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GEO里面同一个文章名字,同一个作者,GPL一致,GSE不一样,发表...

这个不好建议,看你的分析目的了,自行选择数据分析

回答于 2022-08-12 09:30