omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

0 赞同

老师就是您在重测序课程里面里面用vcftools工具过滤和群体遗传...

你要理解每个过滤参数的意义，选择合适的参数过滤，每个项目不一样没有对错之分；你再仔细看看视频讲解吧；你觉得过滤太多了，就不设置这个参数过滤即可或者设置 --minGQ 0

回答于 2025-01-04 16:42

0 赞同

这个一般默认参数即可；

回答于 2025-01-04 09:05

0 赞同

--minGQ 80 这个参数去掉试试，这个参数过滤的比较狠；

回答于 2025-01-04 09:03

0 赞同

数据有特殊没有拟合出曲线报错，你检查你的数据，是不是基因数量太少等情况；

回答于 2024-12-31 09:58

0 赞同

你的powershell里面没有gzip这个命令

回答于 2024-12-29 09:05

0 赞同

联系客服处理：点击联系客服

回答于 2024-12-29 09:04

0 赞同

建议截图说明问题，我们的docker镜像里面已经安装了openssh的；要把数据放到容器里面，你需要把数据放着-v 设置的主机上的文件夹即可

回答于 2024-12-29 09:02

0 赞同

看视频课程，按照老师的操作步骤来就行；具体问题你截图说明；docker是软件分析环境，你按照老师的演示操作即可；建议用我们的的云服务器：https://study.omicsclass.com/index

回答于 2024-12-26 17:04

0 赞同

镜像加载有问题建议重新下载镜像再次加载试试的；

回答于 2024-12-24 08:16

0 赞同

可以提供参考数据库，如果没有参考数据库是根据缺失SNP周围的SNP结合LD情况推断的，具体可以参考beagle参考文献

回答于 2024-12-24 08:15