omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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合并gvcf的问题

你这个不是GVCF，不能用这个方法合并；我看你的文件是普通的vcf文件；

回答于 2022-08-12 09:29

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搜索的时候有个ID map 文件你下载一下，有对应关系，自己手动替换就行

回答于 2022-08-12 09:26

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没用过 TBtools你核查下数据吧

回答于 2022-08-10 16:59

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修改升级一下脚本：插入以下代码： elsif ($call[0] =~ /1[\/\|]0/) { print OUTFILE "\t", $splitline[4], $splitline[3]; }

回答于 2022-08-10 16:46

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嗯，只有一个mRNA一样正常的；

回答于 2022-08-08 11:51

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看这个

回答于 2022-08-08 11:51

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基因上游的序列为promoter 序列； promoter不在基因上；

回答于 2022-08-08 11:49

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从ATG往上截取1500bp的

回答于 2022-08-07 12:03

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VCF文件和参考基因组不是配套吧，你检查一下；

回答于 2022-08-04 13:36

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可以分别搜索再合并；

回答于 2022-08-02 10:16