omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

0 赞同

物种分类树图

检查你的输入数据，是不是有的行，没有 k__Bacteria，如果有得话把他删除试试

回答于 2022-06-29 14:17

0 赞同

建议选择紫色的数据，可以直接从拼接开始做，再有，你的数据怎么处理的还是得咨询测序公司，我这里只是猜测；

回答于 2022-06-29 14:08

0 赞同

这个length required 是把小于这个值的序列删除；你这个设置个280bp左右即可；保留大部分的read 还有就是你的引物扩增的区域（V3？V4 or V3+V4？）长度做参考；

回答于 2022-06-29 14:05

0 赞同

跑一天正常的，想速度快只能提高电脑配置；数据量再多可能会跑好几天

回答于 2022-06-29 13:56

0 赞同

这个 segmentation fault 报错，可能是系统问题，你换个电脑试试的；

回答于 2022-06-29 09:32

0 赞同

看不懂 shell，你看结果文件，照着用excel做一个表格，粘贴到notepad 里面保存一下就行；

回答于 2022-06-29 09:30

0 赞同

只是警告没事的

回答于 2022-06-29 09:29

0 赞同

有蛋白序列就可以分析，无参转录组组装的unigene，也会翻译成蛋白，有蛋白序列就可以分析；

回答于 2022-06-25 22:04

0 赞同

先检查一下你的输入文件路径啥的，文件格式是否正确；打开看看

回答于 2022-06-25 22:00

0 赞同

输入文件都打开看看，文件直接基因的ID不对应吧； pair 文件是不是用tab分割的？检查一下；

回答于 2022-06-23 17:13