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3849 个回答

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老师 这是你们给的测试数据,我在注释的第一步就遇到下面的问题...

只是警告,不是报错,没问题的。你看看结果文件是否有输出。

回答于 2024-06-27 16:50

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自己运行Shell脚本的过程和课堂介绍的不同,请问是否提示我运行...

看看那个.o 文件,有没有报错; 如果没有报错,是因为程序运行到不同阶段,看上去进程不一样;正常现象

回答于 2024-06-27 16:16

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iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bn...

这里的编码就没问题,除此之外可能报错:https://www.omicsclass.com/article/409

回答于 2024-06-27 11:12

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老师您好,用tassal跑出的曼哈顿图没有数据点,但qq图正常,gemm...

检查所有的输入文件,你可以head截图一下,帮你看看

回答于 2024-06-27 11:10

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老师,为什么我找的家族在本物种里的结构域会这么少呢?换了个物...

家族基因的数量,不同的家族数量差异大; 你查查文献看看相同的家族在近源物种中的数量。如果数量也差不多这么多说明没问题;如果差异太大可能有问题; 有问题你检查输入的基因组蛋白数量全不全是否有遗漏等;

回答于 2024-06-26 17:42

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iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bn...

转换的phy文件打开看一下,这里DNA的核酸编码:https://www.omicsclass.com/article/409,是不是还有其他字符? 检查一下;

回答于 2024-06-26 17:36

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基因家族分析2.0,做基因结构分析时报错,完全按照提供指令做的

-out 参数没有设置,你需要仔细认真些;

回答于 2024-06-26 07:23

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RNA 速率分析Pseudotime vs latent time

Depending on what mode you run scVelo in (the default stochastic model or the dynamical model) you will get a metric called velocity_pseudotime (stochastic) or latent_time (dynamical) the differences are in how it calculates the splicing model but they're both metrics of cell's position in time li...

回答于 2024-06-26 07:19

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老师,请问Ensembl、phytozome这两个网站没有收录我的目标物种,...

问基因组发布的作者要GFF文件;或者自己注释一个;

回答于 2024-06-25 13:57

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老师,这一步有啥问题呀?麻烦老师帮忙看看,第二张图是我重新删...

文件路径不对,你检查pl脚本文件路径是否正确;

回答于 2024-06-25 13:56