课程里面有例子文件你照着例子做就行; https://zzw.h5.xeknow.com/s/qZRiF
回答于 2022-04-28 09:37
课程第一节 PPT里面有资料代码下载方法,你去看一下就可以下载代码了; 课程链接: https://zzw.h5.xeknow.com/s/1w3axx
回答于 2022-04-28 09:33
把40个样本数据等量混合,重新callSNP,再做BSA; 或者不混合做GWAS关联分享;
回答于 2022-04-28 09:32
新docker 基于WSL的; 课程里面的是基于hyper-V的,下载老版本的docker 重新安装,和老师的保持一致: 下载Docker desktop 安装包:https://download.docker.com/win/stable/43472/Docker%20Desktop%20Installer.exe
回答于 2022-04-28 09:27
排下序就行,用排好序的文件再输入即可避免错误: #利用tassel软件对文件进行排序run_pipeline.pl -Xmx30G -SortGenotypeFilePlugin -inputFile clean.vcf.gz \ -outputFile clean.sorted.vcf.gz -fileType VCF#vcf文件格式转换成Phylip格式,用于后续构建进化树run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess $workdir/00.fi...
回答于 2022-04-28 09:22
看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/4105
回答于 2022-04-26 10:12