omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
13660金币数
76790 经验值
419个粉丝
主页被访问 72640 次

3850 个回答

0 赞同

蛋白质ID如何转换为Gene的ID

转换比较麻烦,做富集分析需要做基因功能注释才行

回答于 2022-04-24 11:53

0 赞同

关于RNAseq的docker分析中获取基因长度报错问题

GTF 文件不标准,有些行缺少gene_id   可能是非编码的基因,可以删除这些行,再重新运行代码:

回答于 2022-04-22 10:54

1 赞同

老师,输入这个代码echo "1\nT-box_domain.fa\n2\n1\ndomain.aln...

这个贴的命令是快捷方式,如果想输入文件名称,你只需要 clustalw  , 进入交换模式才行;

回答于 2022-04-22 09:26

1 赞同

使用evolview美化进化树时,执行部分填充命令,却会填充所有线条...

你的范围跨了两个大枝,  你分两行写分布填充颜色吧

回答于 2022-04-21 11:14

0 赞同

使用hisat2比对时结果出错

任务被杀死了,电脑的内存不够导致的

回答于 2022-04-21 11:12

0 赞同

请问jcvi分析生成simple文件时--minspan=30指的是什么?

看看这个:https://www.omicsclass.com/question/3680

回答于 2022-04-21 11:11

0 赞同
0 赞同

我在haplotypecaller的时候没有设置样本倍型,这个数值是默认二...

一般都设置成二倍体,

回答于 2022-04-19 08:28

0 赞同

python rpy2 报错

添加环境变量: export R_HOME=/share/work/biosoft/R/R-v4.0.3/lib64/R export LD_LIBRARY_PATH=${R_HOME}/lib:${LD_LIBRARY_PATH} 又报错: Python 3.8.12 (default, Apr 17 2022, 10:38:39)[GCC 6.4.0] on linuxType "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.>>> import r...

回答于 2022-04-18 11:19

0 赞同

如何修改Jcvi的layout文件作出如下图所示的多物种间的共线性图

这里有文章叫你多多基因组:https://www.omicsclass.com/article/501

回答于 2022-04-18 10:08