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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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sam 转换成bam 格式并排序时,没转换成功。reads 与基因组进行比...

索引文件没有建立成功,可能是内存不够导致的,你按照这个方法尽量多个docker内存: https://www.omicsclass.com/article/1413  

回答于 2022-04-06 13:58

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老师您好,我在fasttree构建系统发育树这一步,程序会被kill掉,...

docker的内存不够会导致杀死或者运行不成功, 按照这个尽量多个docker内存:https://www.omicsclass.com/article/1413  

回答于 2022-04-06 13:56

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老师,我在共线性分析作图时出现了问题,您能帮我看一下吗

染色体太多,mcscanX自带的绘图不好展示,用后面课程里面的circos展示吧

回答于 2022-04-06 13:55

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老师您好,我在用iqtree绘图和pca绘图这里都遇到了行列数量不同...

把你的分组文件从excel里面粘贴到一个文本文件,注意用notepad++编辑;

回答于 2022-04-06 13:53

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在进行docker中blast分析时,请问有谁知道怎么从第一个界面退回...

按 q键可以退出less命令 linux基础课需要学习一下:https://bdtcd.xetslk.com/s/17gwqZ

回答于 2022-04-06 13:51

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老师,您好,昨天我跟着您的视频在docker上做blast分析,但我不...

按 q键可以退出less命令 linux基础课需要学习一下:https://bdtcd.xetslk.com/s/17gwqZ

回答于 2022-04-06 13:50

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系统进化树图上没有分成亚家族独立分支

全长序列构建进化树,差异大的话,适当删除一些不保守的区域,之后再构建进化树。

回答于 2022-04-02 12:54

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我想问下基于Fst$pi进行选择性消除分析时,所关注的群体的右边受...

应该是A或者B群体受选择的区域都在里面; 文件内容截图一下,可以帮你指出。 里面有一列标记了时A群体还是B群体受选择的行,你可以用excel筛选一下就好了;

回答于 2022-04-02 12:53

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大家好!我想问下Fst&pi进行选择性消除分析后,得到的fst-pi.A-v...

应该是A或者B群体受选择的区域都在里面; 文件内容截图一下,可以帮你指出。 里面有一列标记了时A群体还是B群体受选择的行,你可以用excel筛选一下就好了;

回答于 2022-04-02 12:52

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计算psmc.fq.gz文件错误,打开全是n,是不是我的bam文件错了

正常的,你继续运行吧 PSMC分析需要测序深度18X以上,深度太低结果会不好

回答于 2022-04-01 13:48