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PSMC分析没有查到mutation rate
对的可以参考亲缘关系近的物种：例如单子叶植物或者双子叶植物有通用的突变速率：https://www.omicsclass.com/question/896
回答于 2024-06-25 13:54
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老师好，我在做群里遗传进化算pca时，得到的文件都是0。
那是不是有包错信息，你可以截图看看的额，不然不知道什么原因； 可能是你的输入文件有问题吧，你吧你的输入文件都打开看看的；
回答于 2024-06-24 13:23
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老师，我这个是桑树的fasta和gff文件，不是从官网下载的。假如各...
只要是标准的 基因组fasta格式和GFF文件格式就可以应用到我们的分析数据的流程中； 你可以打开文件看看和我们提供的示例文件格式是否一致；
回答于 2024-06-24 13:21
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老师，用admixture做群体结构时，可以绘制单独一个k值的结构图吗...
我们的脚本输出的文件有PDF版本的额，你可以把pdf图片导入 adobe illustrater 中手动修改字体，或者删除其他K值的图片；
回答于 2024-06-24 13:19
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老师您好，我按照课程提供的流程泡自己的数据，在fst pi tajim...
这个文件的染色体ID（pi.wild.windowed.pi ）和fai文件的染色体ID核对一下： 染色体ID 严格区分大小写，要一模一样才行
回答于 2024-06-23 11:16
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老师，下面是报错、染色体信息、gff文件中的染色体和命令行
上面不是有提示吗，那个转录本没有基因，你在GFF里面搜索一下看看有啥异常，看不出了就截图我帮你看看；
回答于 2024-06-20 15:20
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泛基因家族分析，提取CDS序列结果如图所示，并且文件大小只有38K...
检查一下是什么原因导致很多基因没有提取到cds序列；主要看看GFF文件格式是不是标准，与基因组是否对应
回答于 2024-06-20 11:42