omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师您好我在做转录组找snp用的软件是gatk，在 HaplotypeCaller...

有可能你只要一个样本吧，导致没有0/0 基因型。

回答于 2022-01-04 17:58

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什么上游分析？？大多时一样的；

回答于 2022-01-04 14:44

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找到对应的平台文件，有对应表；

回答于 2022-01-04 14:43

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根据基因家族的特点，自行选择删除；

回答于 2022-01-04 14:42

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网上的中文文档都是从这里来的：https://github.com/OpenGene/fastp 要学会看官方说明文档；

回答于 2022-01-04 14:41

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命令行使用错误，建议学习课程吧: https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2022-01-04 14:39

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seqid里面的染色体名称和blast里面的染色体ID不一致：https://www.omicsclass.com/question/1361

回答于 2022-01-03 09:25

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建议学习基因家族分析课程： https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2022-01-03 09:22

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你的文件路径和命令行看不到，你自己检查一下输入数据的路径是否正确，

回答于 2021-12-30 17:38

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没做过这个，不清楚

回答于 2021-12-28 17:18