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3849 个回答

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VCF注释

如果是用的是我们提供的镜像,那你这个vcf文件对应位置的SNP可能有问题,或者基因组上这个位置碱基是不是杂合的,你检查一下;

回答于 2024-05-16 15:44

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cafe5 Families with largest size 删掉这些基因家族后跑的非常...

如果太慢多给些线程--cores ; -k 值自己选择吧,不比较 运行到k 3 也可以;

回答于 2024-05-16 12:16

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用4d位点跑mcmctree报错Error: strange calibration?.

用的是我们的docker镜像吗? 如果不是可能是软件安装问题;

回答于 2024-05-16 09:34

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Launch_PASA_pipeline.pl脚本报错连不上mysql?

不会配置mysql就使用sqlite数据库吧;

回答于 2024-05-16 09:31

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mcmctree运行报错"error: raise NGENE?"

看看这个ndata这变量是否设置正确,和你的输入基因数量一致,打开mcmctree.ctl 文件看看的;

回答于 2024-05-16 09:27

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老师你好 我在进行保留最长转录本的时候 服务器出现这个警告

警告一般忽略即可,如果觉得可疑,可以到GFF里面去搜索对应的ID看看格式是否有异常; 或者是nc RNA 就不用处理了;

回答于 2024-05-14 16:22

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老师我做比较基因组的时候,准备文件阶段时用ncbi 下载的基因组...

高效的提问应该把所有输入文件以及命令行都贴一下图,最后再贴报错信息,初学者大多都是输入文件格式错误导致报错; 这个提示错误:这个脚本的路径写错了,你看看示例文件,改过来;

回答于 2024-05-14 11:14

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单细胞测序数据做聚类分析后图片聚类结果不清晰且很丑,应该调整...

可以用R语音读入RDS 文件手动修改输出PCA图片:https://satijalab.org/seurat/reference/dimplot library(Seurat)pbmc=readRDS("pbmc.rds")DimPlot(object = pbmc,reduction='pca')

回答于 2024-05-14 11:07

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单细胞测序数据rds文件替代某列信息

这个你需要用R语音读入rds文件,然后编写R代码手动修改数据框即可;

回答于 2024-05-14 11:02

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运行mcmctree报错

看这个回答:https://www.omicsclass.com/question/6832

回答于 2024-05-14 10:14