必须所有的GVCF都生成一起合并,不能分批合并; 生成了gvcf文件之后,bam文件后续不用可以删除; 后台任务杀死可以用 ps -xf 查看任务PID 然后用kill杀死任务,如果用我们的服务器,登录的时候有个使用手册建议看看有说明;
回答于 2025-01-06 13:47
检查你vcf文件里面第一列染色体ID是不是和你命令行里面的对应; 再检查群体样本ID列表和VCF里面的是不是对应;
回答于 2025-01-05 16:34
你要理解每个过滤参数的意义,选择合适的参数过滤,每个项目不一样没有对错之分;你再仔细看看视频讲解吧; 你觉得过滤太多了,就不设置这个参数过滤即可 或者设置 --minGQ 0
回答于 2025-01-04 16:42