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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4141 个回答

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参考基因组这个docker怎么练到filezilla,为什么我没法安装opens...

建议截图说明问题,我们的docker镜像里面已经安装了openssh的; 要把数据放到容器里面,你需要把数据放着-v 设置的主机上的文件夹即可

回答于 2024-12-29 09:02

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新手小白,刚开始学习docker,想问一下,做泛基因家族分析最开始...

看视频课程,按照老师的操作步骤来就行;具体问题你截图说明;docker是软件分析环境,你按照老师的演示操作即可; 建议用我们的的云服务器:https://study.omicsclass.com/index

回答于 2024-12-26 17:04

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加载镜像出问题

镜像加载有问题建议重新下载镜像再次加载试试的;

回答于 2024-12-24 08:16

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老师您好,使用beagle 进行基因型填充的时候填充依据是什么啊,...

可以提供参考数据库,如果没有参考数据库是根据缺失SNP周围的SNP结合LD情况推断的,具体可以参考beagle参考文献

回答于 2024-12-24 08:15

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老师们好,在生成gvcf文件合并vcf文件时,出现这种警告信息,请...

只是警告。忽略即可,不影响后续分析

回答于 2024-12-23 17:01

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泛基因家族分析cds提取出现killed

数据量大,需要电脑内存足够才行,不然系统会自动杀死:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2024-12-23 10:19

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SoupX去除污染RNA

没有用过这个软件,建议你看看他的软件说明吧:https://github.com/constantAmateur/SoupX

回答于 2024-12-22 15:55

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KEGG富集分析

这个没法调整,你可以试试输入通路试试,比如 GO,REACTOME等;如果还是没有说明你的差异分组没有通路富集; 或者换一种富集方法,GSEA富集方法;

回答于 2024-12-22 15:53

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vcftools 过滤等位基因。 老师,用的同样是vcftools过滤indel sn...

看看你的过滤条件是不是太严格了,你适当放宽条件; 不同的数据测序深度,样本数量都不一样,灵活调整参数; 不知道你的过滤条件是啥,最好把你的数据基本情况介绍一下,使用的命令行贴一下好给你建议;

回答于 2024-12-22 09:34

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单细胞高级分析代码的报错求助

建议截图解释问题,不知道你是运行R命令,还是shell命令; 你这个文件在当前文件夹吗?检查一下: celltype.tsv  如果在,打开看一下内容是否正确

回答于 2024-12-20 18:33