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3849 个回答

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老师 为什么我进行nextdenovo组装完成后,在03.ctg_graph文件中...

程序没有跑完终止了吧,你看看输出日志log文件有没有异常,或者重新跑一下;

回答于 2024-04-24 09:10

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老师,我在用GSDS绘制顺势原件作用图的时候,只显示一部分基因的...

检查gene.bed 文件里面的第一列ID有没有重复的有重复删除,再检查gene.bed文件里面的这些没有显示的ID在feature.bed 是否存在; 如果是用windows记事本编辑过这些文件,建议用专业的文本编辑器编辑,并设置utf-8格式:https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2024-04-23 09:31

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在执行命令的时候,遇到软件需要更新版本,怎么处理,

可以不用更新,忽略即可;

回答于 2024-04-22 18:18

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关于annover建库问题

看输出日志建库没问题,如果注释还有问题,那可能是你的vcf格式问题,这个需要调试才行;

回答于 2024-04-22 18:17

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Error running system command: </biosoft/annovar/2018Apr16/ta...

VCF文件没有格式问题,检查你的ANNOVAR的库是不是构建正确

回答于 2024-04-22 15:32

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16S扩增子分析中聚类分析出现问题。

这个脚本有两个输入文件,你看看你的$metadata 文件,第50行是不是有问题; 如果在windows编辑文件,建议用专业的文本编辑器,避免windows和linux的兼容问题:https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2024-04-22 11:38

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不同组扩增子数据长度差距太大,如果一起分析是不是结果不太好,...

不同批次的数据qiime2数据可以分开分析再合并: https://forum.qiime2.org/t/how-to-analyze-together-different-batches-of-samples/15524 https://docs.qiime2.org/2024.2/tutorials/fmt/ 如果长度差异太大建议:看看这个:https://forum.qiime2.org/t/merging-two-projects-with-different-raw-file-types-to-perfo...

回答于 2024-04-22 10:50

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在组装线粒体时日志文件显示出现了如下的错误请问是什么原因呢

从报错信息看不出啥来,建议用我们的构建的docker镜像分析数据,避免软件安装问题导致的报错;

回答于 2024-04-22 09:26

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JGI下载的文件,哪个是基因组文件和gff文件呢

一般下载这几个文件,基因组文件你截图没看到:

回答于 2024-04-22 09:17

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LDdecay衰减距离如何确定?

LD衰减距离是R2最大值与最小值中间的值对应的距离就是平均衰减距离;课程里面有讲的:https://bdtcd.xetslk.com/s/3QzQFb 不平滑和你的群体数据有关系,个体差异数量等;

回答于 2024-04-22 09:14