程序没有跑完终止了吧,你看看输出日志log文件有没有异常,或者重新跑一下;
回答于 2024-04-24 09:10
检查gene.bed 文件里面的第一列ID有没有重复的有重复删除,再检查gene.bed文件里面的这些没有显示的ID在feature.bed 是否存在; 如果是用windows记事本编辑过这些文件,建议用专业的文本编辑器编辑,并设置utf-8格式:https://www.omicsclass.com/article/395
回答于 2024-04-23 09:31
VCF文件没有格式问题,检查你的ANNOVAR的库是不是构建正确
回答于 2024-04-22 15:32
这个脚本有两个输入文件,你看看你的$metadata 文件,第50行是不是有问题; 如果在windows编辑文件,建议用专业的文本编辑器,避免windows和linux的兼容问题:https://www.omicsclass.com/article/395
回答于 2024-04-22 11:38
不同批次的数据qiime2数据可以分开分析再合并: https://forum.qiime2.org/t/how-to-analyze-together-different-batches-of-samples/15524 https://docs.qiime2.org/2024.2/tutorials/fmt/ 如果长度差异太大建议:看看这个:https://forum.qiime2.org/t/merging-two-projects-with-different-raw-file-types-to-perfo...
回答于 2024-04-22 10:50
LD衰减距离是R2最大值与最小值中间的值对应的距离就是平均衰减距离;课程里面有讲的:https://bdtcd.xetslk.com/s/3QzQFb 不平滑和你的群体数据有关系,个体差异数量等;
回答于 2024-04-22 09:14