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我现在的数据格式，怎么进行GO和KEGG富集分析呢？
需要先建GO KEGG注释库，之后才可以做富集分析这里有非模式物种KEGG与GO富集分析课程你看看的：https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM
回答于 2024-04-17 23:12
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为什么我hifiasm组装出来的文件基本都是空的呢？
hifiasm 主要用pacbio ccs的HiFI测序数据组装，你的ONT的数据错误率高 组装不出来；
回答于 2024-04-16 09:00
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运行 ParaAT 多序列比对 出现报错
这里有基因ID，你找到对应ID的cds和蛋白序列检查他们之间是不是3倍关系；确认解决一下； 如果数量不多，可以把这样的基因对删除
回答于 2024-04-15 18:32
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如何确定选择分析中的窗口和步长？
窗口和步长没有固定的，你可以根据基因组大小，平均连锁距离来合理设置； 基因组大可以适当加大窗口长度，L D连锁大也可以加大窗口； 也可以多试试几组数据，看看哪个效果好用哪个了；
回答于 2024-04-15 18:29