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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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进行16S分析时,对样品按照分组进行分类汇总出现问题。

请按照课程里面的方法准备metadata文件,qiime1和qiime2 都兼容的格式,视频课程里面有讲解的:https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF 还有课程里面分组名字是group和type,你的分组名字需要相应更改才行。

回答于 2024-03-25 10:15

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vcftools过滤除了等位基因选项外,其他参数通通没用

vcf格式有问题吧,看看带##号的开头行注释有问题: 建议去掉这个参数试试的:--minGQ 80 

回答于 2024-03-25 10:12

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PSMC出图报错

文件文件夹命名不要有空格,否则会比较麻烦:

回答于 2024-03-25 10:04

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不同物种间的同源基因对Ka/Ks计算需要用哪些文件呢

需要不同物种的同源基因的cds序列文件;

回答于 2024-03-25 10:03

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在进行二代测序数据的nt比对时出现了以下报错请问应该怎么解决

blast 的nt需要库文件,你要下载库文件,不然需要自己建库才行。

回答于 2024-03-25 10:02

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在无参转录组中,如果之前有人鉴定过某一物种的转录组并为相关基...

也可以不用命名像这篇文章直接用基因的ID: 文献:https://academic.oup.com/hr/article/doi/10.1093/hr/uhae033/7593780

回答于 2024-03-18 16:22

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一个家族基因隐马尔科夫模型

模型是公用的,不分模式物种和同源物种

回答于 2024-03-18 12:54

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在使用Gepard时出现了这样的图,与教程中的不一样,请问是哪里除...

上面有一段倒转了,你检查检查是组装错误,还是真实的差异;

回答于 2024-03-15 14:03

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单倍型分析中最后一步失败,麻烦老师

删除镜像,重新下载遗传进化镜像 ,这个最近更新了:https://www.omicsclass.com/article/2286

回答于 2024-03-15 14:01

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老师好 plink分析pca 一直报错

刚刚测试过没问题的: 可能由于系统原因,建议更换电脑试试,或者使用我们的云服务器:https://study.omicsclass.com/index

回答于 2024-03-15 14:00