omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师好，我在虚拟系统中筛选出53个基因，去两个网站上比对结构域...

如果全长序列差异太大建议用结构域序列构建进化树，检查很短的6条序列是否具有完整结构域，酌情删除。

回答于 2019-07-23 10:02

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新手不建议自己改文件格式，自己下载课程中对应的文件，再找找看吧；基因组发布了，这些文件肯定有的；

回答于 2019-07-22 18:05

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基因不多的话，可以用 adobe illustrator 手动绘制

回答于 2019-07-22 18:03

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高版本的hmmsearch 会报这个错误，建议删除这个参数--cut_tc hmmer 3.1b2 不会报错，

回答于 2019-07-22 10:45

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出现什么问题？问题描述清楚

回答于 2019-07-22 10:31

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layout文件最后的多余的空行删除一下，试试： https://www.omicsclass.com/article/571

回答于 2019-07-22 10:30

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可以查找文献看看别人的研究成果。

回答于 2019-07-22 10:27

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看看hmmer搜索的结果第一列ID与fasta序列中的ID是否一致；

回答于 2019-07-22 10:15

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名字有问题，去掉gff3试试：

回答于 2019-07-22 10:13

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首先把 gene:等修改一下，然后根据下面生成的转录本ID与基因ID对应关系，通过excel 中Vlookup 查找对应关系；

回答于 2019-07-22 10:10