烟草基因组上传到了茄科物种的基因组数据库网站:https://solgenomics.net/ 普通烟草基因组:https://solgenomics.net/organism/Nicotiana_tabacum/genome 基因组数据有两个版本分别是(点击链接可下载基因组信息):Edwards 2017 和 Sierro 2014 参考文献: Edwards, K. et al. A reference genome for Nicotiana taba...
回答于 2019-06-18 16:24
从NCBI的SRA数据库当中下载高通量测序数据有很多方法,这里简单的方法可以用迅雷下载:https://www.omicsclass.com/article/53
回答于 2019-06-08 12:41
FPKM 的计算原理可以学习:有参转录组结果解读 如果想自己从原始测序文件比对获取fpkm需要自行分析转录组:转录组自主分析
回答于 2019-06-08 12:40
共享目录不能自动挂载,每次关键重启之后需要把共享目录的挂载命令重新运行一下就好; 共享目录的设置方法:https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2019-06-08 12:29
看看你的cds序列中的ID是否在gff中能搜索到?如果能搜索到,你需要编写脚本把对应的ID关系批量的提取出来; 建议学习perl语言可以完成: perl入门到精通、perl语言高级 如果自己没有编程基础,无法处理,建议不要在NCBI上下载参考基因组,其他enseml 或者JGI等数据库下载参考基因组;
回答于 2019-06-06 10:57