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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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3898 个回答

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老师您好,circos图的配置文件能否给我发一下感谢!

这里有配置文件你看一下:https://www.omicsclass.com/article/644

回答于 2019-06-05 09:04

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老师好!做比较基因组分析时/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/...

可以将输入文件都截图一下,才好分析文件是哪里出错了; 或者,这个错误可以参考一下这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/572

回答于 2019-06-04 10:56

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如何获取基因与mRNA的对应关系?

看你最初的GFF文件应该没有文件,是直接可以用脚本得到对应关系的,你不需要删除v2.2 如果非要删除v2.2建议使用这个命令: sed -i 's#\.v2.2##g' xxxx.gff3 更多命令可参考:linux系统使用

回答于 2019-06-03 13:02

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虚拟机软件使用问题

该软件没有安装到biolinux中,需要自行安装;

回答于 2019-06-03 11:21

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老师,MEGA画完树后出图PDF,但是获得不了完整的图,PDF只有四分...

建议导出nwk文件格式的tree文件,然后用evolview网站美化进化树:https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2019-06-03 11:20

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RNA-seq的转录水平表达分析HISAT, StringTie and Ballgown 中R语...

fold changes only available for 2-group comparisons 只能两两比较,你可能输入的分组信息有三组,你检查一下;bg_chrX_filt这个数据里面分组列orgnization里面是不是两个水平; R 语言不懂可以学习: R语言快速入门与提高 R语言画图、

回答于 2019-05-29 18:07

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按照课程中用MEGA建树时,一直建不成功

序列差异太大,所以无法构建进化树,你检查一下时间:这些是不是应该去掉:

回答于 2019-05-29 10:50

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pfamscan的translate选项应该怎么使用

translate命令应该添加到环境变量PATH当中;这个命令应该是在安装hmmer的时候有的: 这个命令应该在hmmer较早的版本中有hmmer-2.3.2,最新版本好像没有,你对应安装一下这个hmmer,然后把路径添加到环境变量中就可以;:

回答于 2019-05-28 18:02

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Blast2go本地化过程中,运行官方文件b2g4pipe_v2.5.zip中“runPip...

blast2GO 本地安装比较麻烦,还涉及mysql数据库设置,出现错误也是很复杂,光看错误不好知道原因,建议先谷歌搜索一下吧;

回答于 2019-05-28 11:34

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perl脚本去除fa文件中ID重复的序列

脚本语法有错误吧,你了解一下perl的语法,张贴可能哪里漏掉了; 最好用editplus等专业的文本编辑器编辑perl脚本语言,不要用windows自带的记事本;

回答于 2019-05-28 11:32