可以将输入文件都截图一下,才好分析文件是哪里出错了; 或者,这个错误可以参考一下这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/572
回答于 2019-06-04 10:56
看你最初的GFF文件应该没有文件,是直接可以用脚本得到对应关系的,你不需要删除v2.2 如果非要删除v2.2建议使用这个命令: sed -i 's#\.v2.2##g' xxxx.gff3 更多命令可参考:linux系统使用
回答于 2019-06-03 13:02
建议导出nwk文件格式的tree文件,然后用evolview网站美化进化树:https://www.omicsclass.com/article/671
回答于 2019-06-03 11:20
fold changes only available for 2-group comparisons 只能两两比较,你可能输入的分组信息有三组,你检查一下;bg_chrX_filt这个数据里面分组列orgnization里面是不是两个水平; R 语言不懂可以学习: R语言快速入门与提高 R语言画图、
回答于 2019-05-29 18:07
translate命令应该添加到环境变量PATH当中;这个命令应该是在安装hmmer的时候有的: 这个命令应该在hmmer较早的版本中有hmmer-2.3.2,最新版本好像没有,你对应安装一下这个hmmer,然后把路径添加到环境变量中就可以;:
回答于 2019-05-28 18:02
blast2GO 本地安装比较麻烦,还涉及mysql数据库设置,出现错误也是很复杂,光看错误不好知道原因,建议先谷歌搜索一下吧;
回答于 2019-05-28 11:34
脚本语法有错误吧,你了解一下perl的语法,张贴可能哪里漏掉了; 最好用editplus等专业的文本编辑器编辑perl脚本语言,不要用windows自带的记事本;
回答于 2019-05-28 11:32