A sequence logo consists of a stack of letters at each position. The relative sizes of the letters indicate their frequency in the sequences. The total height of the letters depicts the information content of the position, in bits. 参考这里:https://en.wikipedia.org/wiki/Sequence_logo
回答于 2019-05-05 11:47
没用过tbtools计算Kaks你可以了解一下kaks :https://www.omicsclass.com/article/699
回答于 2019-04-30 12:40
检查输入的fasta文件中染色体ID与位置中的染色体ID是否一致? 如果一致,输入的基因位置信息也按不同染色体分成不同文件。
回答于 2019-04-29 21:08
请使用我们百度云盘提供的最新biolinux:https://www.omicsclass.com/article/526 里面的软件都有安装。
回答于 2019-04-29 10:35
脚本会把基因组文件都读取到内存当中,所以非常消耗内存,如果内存不够需要增加内存才行。 电脑内存不够,为了防止电脑死机,系统自动杀死了任务: 看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2019-04-29 10:31
这是由于你的gtf和参考基因组里面的染色体编号不匹配;检查是否下载错误的gtf 比如有的注释有问题,gff里面基因在染色体上的位置,比染色体都长等等,导致fasta序列提取错误。
回答于 2019-04-27 22:10