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已有一段序列及相应的氨基酸如何blast基因组中的基因家族
blast正常搜索就可以，blast的用法在我们基因家族课程里面有的。 先建库再比对就可以了； 学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2019-04-12 13:52
物种间共线性分析染色体不显示字母
python版本的：mcscan会自动去除染色体名称中的字母，你可以用Adobe illustrator 打开PDF文件，进行修改一下就可以；
回答于 2019-04-12 13:50
老师好，我按照您的代码用itol做的外层圆环只有一种颜色，想呈现...
可以试试用这个软件添加分组，个人觉得更好用：https://www.omicsclass.com/article/671
回答于 2019-04-12 08:54
你好，我目前正在用WGCNA但不知表达矩阵怎么构建？
可以学习一下这个课程，里面有代码可以自己实现：学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 如果没有R语言基础可学习：R语言画图、R语言快速入门与提高
回答于 2019-04-12 08:52
老师，我利用脚本得到对应基因的蛋白序列： perl script/get_fa_...
基因家族已经更新，需要到前两节中重新更新脚本，建议重头开始看视频； 看视频要仔细： linux基础不好要学习：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据
回答于 2019-04-11 19:45
老师，在做基因的顺势作用原件的过程中，最后形成两个配置文件，...
看不懂脚本，建议将结果粘贴到excel，手动筛选； 想学习linux可以：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据
回答于 2019-04-10 16:25
老师好，我的基因组gff文件基因的id名字后面还有外显子内含子等...
看你的输入文件都没有问题，应该是脚本出来问题，可以把19行修改一下，如下： 这个部分，已经更新到基因家族参考资料中，如果不修改脚本，可以重新下载打包文件。替换一下就可以；
回答于 2019-04-10 16:19
大家好，谁有cytospace软件安装包和相应的java能不能发一下
java下载安装方法如下：https://www.omicsclass.com/article/298 cytospace官网可以下载：https://cytoscape.org/ 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接...
回答于 2019-04-10 09:59