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3898 个回答

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老师,两个物种间共线性分析报错了,该怎么解决呢

bed文件和blast文件里面的ID对应吗? 可以把输入文件都head截图一下,重新更新问题;

回答于 2019-03-29 08:58

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如果计算kaks结果文件里没有ka ks值,但有Divergence-Time得值...

不能直接拿来用,分离时间还需要知道物种进化过程中的突变速率,详情见:https://www.omicsclass.com/question/896

回答于 2019-03-28 13:19

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基因启动子序列预测还有没有别的方法?课件里讲到的网站上没有我...

启动子序列预测可以试试,promoter 2.0试试:http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

回答于 2019-03-28 13:13

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linux中无法显示share文件夹

建立共享目录可以参考这里:https://www.omicsclass.com/article/260 linux基础不好建议学习:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据

回答于 2019-03-26 17:45

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TCGAbiolinks包

最新的bioconductor 软件安装已经更新,请参考以下代码安装bioconductor上的TCGAbiolinks包: To install this package, start R (version "3.5") and enter: 确保R版本高于3.5 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TCGAbiolinks", versi...

回答于 2019-03-25 10:48

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下载拟南芥基因组注释文件老是报错

下载失败吗? 可以参考这里下载拟南芥基因组:https://www.omicsclass.com/article/58

回答于 2019-03-25 10:44

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用qiime识别16S测序结果的嵌合体(chimera)要多久?为什么等好...

没用过qiime去除嵌合体,我们用的是mothur,去除嵌合体,需要很长时间,耐心等待; 嵌合体参考:https://www.omicsclass.com/article/8

回答于 2019-03-25 10:41

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kaks分析复制基因

可以参考一下这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/700  看看输出的格式是不是选错了;

回答于 2019-03-23 12:23

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fastq文件前面的预处理

我觉得你的fastq2数据是不是弄反了,测序开始的几个碱基抖动很大才对; 质量值高的话不用切掉; 不知道你的数据具体情况,反了是不是错了,问一下你的测序公司吧; fastq文件解读见:二代fastq测序数据解读

回答于 2019-03-22 19:30

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blast分析重复基因对

E 值越小越好,0说明非常小了,比对结果非常可靠,怎么能说影响结果呢? 具体blast结果说明见:https://www.omicsclass.com/article/505

回答于 2019-03-22 19:28