不能直接拿来用,分离时间还需要知道物种进化过程中的突变速率,详情见:https://www.omicsclass.com/question/896
回答于 2019-03-28 13:19
启动子序列预测可以试试,promoter 2.0试试:http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/
回答于 2019-03-28 13:13
建立共享目录可以参考这里:https://www.omicsclass.com/article/260 linux基础不好建议学习:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据
回答于 2019-03-26 17:45
最新的bioconductor 软件安装已经更新,请参考以下代码安装bioconductor上的TCGAbiolinks包: To install this package, start R (version "3.5") and enter: 确保R版本高于3.5 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TCGAbiolinks", versi...
回答于 2019-03-25 10:48
没用过qiime去除嵌合体,我们用的是mothur,去除嵌合体,需要很长时间,耐心等待; 嵌合体参考:https://www.omicsclass.com/article/8
回答于 2019-03-25 10:41
我觉得你的fastq2数据是不是弄反了,测序开始的几个碱基抖动很大才对; 质量值高的话不用切掉; 不知道你的数据具体情况,反了是不是错了,问一下你的测序公司吧; fastq文件解读见:二代fastq测序数据解读
回答于 2019-03-22 19:30
E 值越小越好,0说明非常小了,比对结果非常可靠,怎么能说影响结果呢? 具体blast结果说明见:https://www.omicsclass.com/article/505
回答于 2019-03-22 19:28