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请问怎么用RNAseq获得的counts数据,再计算相应的FPRM值呢?求较...

这里有FPKM的详细定义和计算方法:https://www.omicsclass.com/article/615 

回答于 2019-03-21 20:13

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老师我想问一下我没有以下这种情况,就是比如说鉴定的马铃薯基因...

你从哪里鉴定的就用哪里的数据,马铃薯数据库里面应该也有注释基因的CDS,你再找找。

回答于 2019-03-21 20:12

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糖苷水解酶家族1 在茶树染色体的定位图

基因位置信息 在基因组注释文件gff文件里面找, 染色体长度在基因组fasta序列中计算一下序列长度就有了。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入...

回答于 2019-03-21 11:20

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老师 我在做blast比对时 由于速度太慢 我使用了diamond命令...

这个没看到文件没法写脚本: 推荐你学习:perl入门到精通、perl语言高级  课程应该可以自己完成脚本编写 还可学习:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、R语言画图、R语言快速入门与提高

回答于 2019-03-21 11:18

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MCScanX分析中collinearity文件没有结果 其余都有 是什么原因呢

可能 本身就没有共线性,所以是空的

回答于 2019-03-20 23:13

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蛋白序列ID和cds序列ID不一致

看命名规律,你把蛋白ID里面的P统一搜索替换成T,这样就和GFF里面的ID一致了; 基础课:linux系统使用

回答于 2019-03-20 14:49

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如何查找某一种功能基因,比如所有的热激蛋白基因,并确定基因数...

简单的方法,是查看你研究物种别人鉴定HSP基因家族的文章,例如:https://www.omicsclass.com/article/84,里面有详细基因的描述。 或者自己利用基因家族分析的方法鉴定HSP基因:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2019-03-20 09:16

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在设置共享文件时,设置不了怎么办,ok键是灰色的

共享文件夹在这里添加删除: 更多共享文件夹设置注意事项:https://www.omicsclass.com/article/260

回答于 2019-03-18 10:28

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老师,我想问一下GEO数据挖掘可以做植物的吗?因为我发现这个都...

GEO数据库里面有植物的数据,你下载对应植物的也是可以分析的:直接到GEO数据库搜索就行 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

回答于 2019-03-17 09:20

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老师您好,我在circos作图时,显示基因基因数目超出最大值怎么办...

真的需要绘制那么多link或者基因吗?  太多绘制出来的图会很乱也说明不了什么问题。

回答于 2019-03-17 09:13