做基因的表达量的话二代测序就好了,而且还便宜。如果要发现新转录本等更多信息可以做三代全长转录组测序,会比二代测序贵一些; 我们也做二代转录组和三代转录组测序:这是我们公司的转录组结题报告,:链接:https://pan.baidu.com/s/1Dljl6Y-1zTaxmqjfq34ybA 提取码:wshm 转录组数据理解不深入,学习链接:转录...
回答于 2019-03-17 09:07
用的是mapchart软件吗? 如果是的话,应该是配置文件有问题,你可以仔细看看这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/397
回答于 2019-03-17 09:02
一个基因有不同的转录本,相同基因不同转录本之间很相似,我推测你这些相似的基因,是来自同一个基因的不同转录本。再有,学习一下gff文件的格式是如何记录基因的信息:https://www.omicsclass.com/article/306
回答于 2019-03-14 21:50
提问时,应该附上参考文献链接,你全文阅读都有问题,所以,我这只能推测:作者下载了别人的转录组数据,转录组数据测了不同组织的基因的表达量。不懂转录组可以看视频学习:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读
回答于 2019-03-14 21:44
如何查找基因家族pfam号,参考:https://www.omicsclass.com/question/268 如果发表的文章都没有提到用pfam号,那你的这个家族基因很有可能就没有pfam号;
回答于 2019-03-14 14:23
关于基因家族基因串联重复基因和片段复制概念可以参考:https://www.omicsclass.com/question/1 你贴图中如果是用mcscanX分析出的几个,我推测蓝色的连线都是segmental duplication events
回答于 2019-03-14 14:19
是的,转录组表达定量,说的就是高通量测序数据。如果经费有限,可以使用以前实验室发表过的文章数据,或者使用别人发表的数据也是可以的,这样成本就降低了;
回答于 2019-03-14 14:17