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3898 个回答

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老师,我想请问一下下面的这个文件里面的数据可以直接用吗?这是...

是表达量 FPKM数据,和你分析的基因ID一致就可以用;

回答于 2019-03-17 09:09

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老师,我想问一下直接从某植物对应的基因组数据库里下载的FPKM文...

可以的,确保基因ID统一就可以;

回答于 2019-03-17 09:07

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我想测小鼠的转录组,初次接触转录组,不知选什么公司,希望可靠...

做基因的表达量的话二代测序就好了,而且还便宜。如果要发现新转录本等更多信息可以做三代全长转录组测序,会比二代测序贵一些; 我们也做二代转录组和三代转录组测序:这是我们公司的转录组结题报告,:链接:https://pan.baidu.com/s/1Dljl6Y-1zTaxmqjfq34ybA  提取码:wshm  转录组数据理解不深入,学习链接:转录...

回答于 2019-03-17 09:07

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请问,我在做基因在染色体定位时,出现了一下的情况,染色体显示...

用的是mapchart软件吗? 如果是的话,应该是配置文件有问题,你可以仔细看看这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/397 

回答于 2019-03-17 09:02

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基因家族分析疑问

一个基因有不同的转录本,相同基因不同转录本之间很相似,我推测你这些相似的基因,是来自同一个基因的不同转录本。再有,学习一下gff文件的格式是如何记录基因的信息:https://www.omicsclass.com/article/306

回答于 2019-03-14 21:50

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我在文献中读到这么一段话,是关于某一基因家族在某植物各个组织...

提问时,应该附上参考文献链接,你全文阅读都有问题,所以,我这只能推测:作者下载了别人的转录组数据,转录组数据测了不同组织的基因的表达量。不懂转录组可以看视频学习:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读

回答于 2019-03-14 21:44

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磷酸转运蛋白家族(PHT1)在Pfam上关键字搜不到pfam 号,在文章...

如何查找基因家族pfam号,参考:https://www.omicsclass.com/question/268 如果发表的文章都没有提到用pfam号,那你的这个家族基因很有可能就没有pfam号;

回答于 2019-03-14 14:23

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关于如何确定segmental duplication events

关于基因家族基因串联重复基因和片段复制概念可以参考:https://www.omicsclass.com/question/1 你贴图中如果是用mcscanX分析出的几个,我推测蓝色的连线都是segmental duplication events

回答于 2019-03-14 14:19

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基因家族后续实验部分,我看您提到说做转录组绘制热图,再筛选一...

是的,转录组表达定量,说的就是高通量测序数据。如果经费有限,可以使用以前实验室发表过的文章数据,或者使用别人发表的数据也是可以的,这样成本就降低了;

回答于 2019-03-14 14:17

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我想问一下基因家族分析后续实验添加部分,只做一种胁迫处理,然...

如果审稿人不提意见的话就可以发。

回答于 2019-03-14 09:01