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老师,请问一下为什么提取基因在染色体上的位置时,查看gene_chr...

请将运行的脚本,还有所有的输入文件都截图,图文并茂的详细描述问题。不然我这里根据你现有提供的信息无法找到原因; 这个问题和你的挺相似的或许可以帮助你:https://www.omicsclass.com/question/994

回答于 2019-03-12 17:14

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基因家族鉴定完后,如何做基因表达?

可以做转录组做基因表达绘制热图,也可以筛选一些家族基因做荧光定量PCR呢,最好两种都做。 具体可以学习:基因家族文献思路解读 实操课程可学习:基因家族分析实操课程、

回答于 2019-03-12 17:11

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我在NCBI上下载的CDS数据,在进行提取基因家族的CDS序列时,提取...

提取序列,不知道你用的是哪个脚本?怎么运行的,输入的文件是什么?  这些都可以截图说明,方便我这里分析原因; 我推测原因: 1.fasta文件,> 后面第一个空格前面的才是序列ID,其他都是序列注释信息,脚本不会读取注释信息; 2.输入的ID列表,要和fasta文件的ID对应一致,才能正确提取成功。

回答于 2019-03-12 17:08

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KEGG代谢通路图中的箭头竖线符号等是什么意思?

可以参考KEGG代谢通路详解说明:https://www.omicsclass.com/article/12

回答于 2019-03-11 16:33

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老师;请问一下这种图应该通过什么网站;软件经行绘制呢?

蛋白质三维结构展示预测,可以用这个在线软件完成:I-TASSER server  这个我用的不多,你自己看看网站使用说明吧; 参考文献: https://academic.oup.com/nar/article/43/W1/W174/2467872

回答于 2019-03-11 16:18

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老师可以利用转录组数据以及蛋白质数据;然后通过BIO-Linux处理...

可以的。 转录组重原始测序数据到表达量,建议学习: 二代测序转录组数据自主分析 如果已经有表达量数据检验学习:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 linux系统的使用学习:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境

回答于 2019-03-11 13:16

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MCSCANX共线性图代码报错

MCScanX的安装,参考:https://www.omicsclass.com/article/275 linux系统不会使用,建议学习:linux系统使用 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习...

回答于 2019-03-11 13:11

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PATL基因家族如何进行鉴定

推荐学习基因家族分析课程里面有详细的鉴定基因家族方法与步骤:学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点...

回答于 2019-03-11 13:06

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请问一下可以通过什么方法得到锌指结构;需要准备什么文件呢?

锌指结构是蛋白质的结构域吗?可以下载锌指结构的hmm模型,用hmmer搜索鉴定。 蛋白质三维结构展示预测,可以用这个在线软件完成:I-TASSER server  这个我用的不多,你自己看看网站使用说明吧; 参考文献: https://academic.oup.com/nar/article/43/W1/W174/2467872

回答于 2019-03-11 10:36

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回答于 2019-03-11 09:02