请将运行的脚本,还有所有的输入文件都截图,图文并茂的详细描述问题。不然我这里根据你现有提供的信息无法找到原因; 这个问题和你的挺相似的或许可以帮助你:https://www.omicsclass.com/question/994
回答于 2019-03-12 17:14
可以做转录组做基因表达绘制热图,也可以筛选一些家族基因做荧光定量PCR呢,最好两种都做。 具体可以学习:基因家族文献思路解读 实操课程可学习:基因家族分析实操课程、
回答于 2019-03-12 17:11
提取序列,不知道你用的是哪个脚本?怎么运行的,输入的文件是什么? 这些都可以截图说明,方便我这里分析原因; 我推测原因: 1.fasta文件,> 后面第一个空格前面的才是序列ID,其他都是序列注释信息,脚本不会读取注释信息; 2.输入的ID列表,要和fasta文件的ID对应一致,才能正确提取成功。
回答于 2019-03-12 17:08
可以参考KEGG代谢通路详解说明:https://www.omicsclass.com/article/12
回答于 2019-03-11 16:33
蛋白质三维结构展示预测,可以用这个在线软件完成:I-TASSER server 这个我用的不多,你自己看看网站使用说明吧; 参考文献: https://academic.oup.com/nar/article/43/W1/W174/2467872
回答于 2019-03-11 16:18
可以的。 转录组重原始测序数据到表达量,建议学习: 二代测序转录组数据自主分析 如果已经有表达量数据检验学习:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 linux系统的使用学习:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境
回答于 2019-03-11 13:16
MCScanX的安装,参考:https://www.omicsclass.com/article/275 linux系统不会使用,建议学习:linux系统使用 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习...
回答于 2019-03-11 13:11
推荐学习基因家族分析课程里面有详细的鉴定基因家族方法与步骤:学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点...
回答于 2019-03-11 13:06
锌指结构是蛋白质的结构域吗?可以下载锌指结构的hmm模型,用hmmer搜索鉴定。 蛋白质三维结构展示预测,可以用这个在线软件完成:I-TASSER server 这个我用的不多,你自己看看网站使用说明吧; 参考文献: https://academic.oup.com/nar/article/43/W1/W174/2467872
回答于 2019-03-11 10:36
感谢您的关注和支持!影响因子滤器下载链接如下:链接:https://pan.baidu.com/s/19Qu0Q49tiK1DCyRjqAKH7Q 密码:m9h3
回答于 2019-03-11 09:02