omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师我想问一下，在鉴定基因家族成员时，可以有什么方法知道成员...

审稿人要是知道确切数量，那他自己肯定鉴定过，发过这个物种这个家族的文章，你的文章肯定发不了；一个家族的成员的数量，有多有少，在不同的物种中差异不会太大；审稿人也会根据其他物种中这个家族大概有多少个，相差别太大就行。更多可观看：《基因家族分析实操课程》

回答于 2019-01-15 11:06

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看看文件是不是有问题，或者格式有问题。

回答于 2019-01-15 09:20

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可以改用mapchart做基因染色体定位分析：https://www.omicsclass.com/article/397

回答于 2019-01-14 17:07

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氨基酸序列太多差异太大，首先看看找的序列是否有正确。如果正确，建议中间的gap也删除一下，或者你找的这些序列有共同的结构域，建议用相同的结构域序列构建进化树；

回答于 2019-01-14 16:41

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我不是很了解你研究的基因家族，只能建议你多看看文献，看看别人在其他物种中研究你的家族是如何分类的可以借鉴一下；读文献学习基因家族分析思路可观看：《基因家族文献解读视频课程》

回答于 2019-01-14 16:34

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get_fa_by_id这个脚本，你给他一个ID列表他就可以给你提取出相应的序列；但是ID必须统一才行。

回答于 2019-01-14 14:14

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你的两个蛋白质文件，不是我们做的转录组，我们不清楚，不能帮你决定取舍；构建进化树，成员比较分散，不同基因家族分类标准不一样，建议你看看类似文章；最后，公司分析注释的都是比较简单的功能注释，我们的课程是详细认真的鉴定基因家族基因，所以说：自己手动鉴定的更准确；不然就没有做的必要了；

回答于 2019-01-14 14:12

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内参基因都是通用的，稳定表达的基因就可以，可以参考：https://www.omicsclass.com/article/110

回答于 2019-01-14 09:24

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unigene是转录本序列也就是DNA序列，鉴定基因家族需要用蛋白质序列。对无参转录组分析结果不了解可以看看我们的课程：《无参转录组结果解读》

回答于 2019-01-14 09:22

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公司做的无参转录组结果，UNigene也有对应的蛋白序列，你再在结果里面找找看；对无参转录组不了解可以看看我们的课程：《无参转录组结果解读》

回答于 2019-01-14 09:21