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关于基因家族中的串联重复基因的删选、Ka/Ks的计算、串联重复基...
串联重复基因的删选、Ka/Ks的计算、串联重复基因Circos等等这些分析内容可参考课程： 《基因家族分析文献解读》 ，分析课程《基因家族分析实操课程》
回答于 2019-01-09 13:25
hmm搜索到的基因特别多怎么办？E值选择有什么样的要求
不同的基因家族有不同的筛选标准，这个需要参考文献，看看别人研究的和你一样的基因家族如何分析的，具体可以看我们网易云课堂，基因家族文献讲解课程，希望会给你一些启发。
回答于 2019-01-09 10:25
视频课程已经学完，有一个问题，视频中演示的搜索拟南芥的NB-ARC...
好好理解一下物种分类：门纲目科属种， 拟南芥的基因组是一个种，不是属，没有混合； 你的一个属里面的不同种的细菌，需要一个一个单独的分析，不能批量混合； 还有，细菌不像高等植物，一个家族的基因有很多个，细菌基因组小，一个基因家族的基因可能只有一个；
回答于 2019-01-08 09:42
Perl GD模块官网例子报错
PNG文件输出是二进制文件，当然是乱码了，你再看看GD包如何输出PNG图片； 绘图不建议用perl的GD包，太麻烦了；建议学习R的绘图 或者perl的SVG绘图；
回答于 2019-01-07 10:20
itol注释文件总有问题
检查文件格式是否正确，尤其是行尾空白记得删除；还是有问题建议使用evolview进行进化树美化：https://www.omicsclass.com/article/671
回答于 2019-01-06 12:29
输入绘制circos图时出现错误
没有找到circos.pl 脚本，或者路径写错，可到参考资料中下载脚本，下载方法看课程第一节； 建议学习linux基础课程，学习效果更佳：linux系统的使用
回答于 2019-01-06 12:27
老师，在鉴定基因家族成员时，不同物种中已鉴定的此基因家族所用...
不同物种的相同基因家族的pfam号是相同的，可以通用： 想自己鉴定搜索可以学：基因家族分析实操课程 还有基因家族分析文献解读，获取分析思路：基因家族文献思路解读
回答于 2019-01-06 12:23