omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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如何利用perl脚本批量提取多个物种的CDS

准备ID列表文件，在输入库文件，这个脚本就可以帮你提取出来呀；注意ID一定要对应；具体的使用方法基因家族课程里面有。也可以学习：perl编程

回答于 2019-01-04 16:11

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我看显示没有任何比对结果，你或者再检查下自己输入的序列；

回答于 2019-01-04 16:00

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看看这里的链接：https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2019-01-04 15:59

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这没事，忽略这个警告就行：共享目录设置方法参考：https://www.omicsclass.com/article/260

回答于 2019-01-04 11:55

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可直接google搜索，或者谷歌学术搜索文献，文献里面有引用文章，再搜索原文；

回答于 2019-01-04 11:32

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有错误，GO.db 这个包没有安装成功，你可以先单独安装这个包，安装成功之后，再安装clusterProfiler

回答于 2019-01-04 11:31

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两个物种的gff文件准备了吗？如果准备了，检查两个物种gff文件和blast结果文件里面的基因ID是否对应；

回答于 2019-01-04 11:29

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不要上传doc 直接贴图，写文字；

回答于 2019-01-04 11:25

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注意D要大写：如果运行成功说明已经安装，一般perl默认这个包都是安装好的

回答于 2019-01-03 13:35

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这里有绘制circos的详细说明你参考一下：https://www.omicsclass.com/article/644 重点关注一下link_dims参数设置

回答于 2019-01-03 13:30