omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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samtools index 遇到的问题，是否正确？

基因组太大了吧，你看看samtools的帮助的；

回答于 2024-02-28 13:10

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把对应的染色体号改成你的染色体号就行了；

回答于 2024-02-28 13:07

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建议下载系统对应的版本用yum安装：https://www.omicsclass.com/article/1887

回答于 2024-02-27 10:42

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zcat clean.vcf.gz|这个就是所有样本共有的SNP；不知道你说的共有概念是什么？

回答于 2024-02-26 18:11

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vbox已经放弃，你用docker吧：https://www.omicsclass.com/article/1198

回答于 2024-02-26 15:29

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这个文件路径变量没有设置对你检查一下：$GENE_LENGTH

回答于 2024-02-26 11:49

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注意分组文件里面多余的空格删除一下：

回答于 2024-02-26 10:11

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你的输入文件有问题吧，结构变异的文件格式可能有些格式问题；建议自己收到转换需要的格式；

回答于 2024-02-26 10:05

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你的输入文件有问题吧，使用的命令和shell文件里面的一样吗？

回答于 2024-02-26 10:03

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自己的样本都有哪些属性，自己用表格填写即可，比如性别，年龄，各种处理等等，自己的列名自己取名即可；你说的这个是别人的样本，tap是别人取的，你要结合自己的样本处理情况准备fastmap文件；

回答于 2024-02-26 10:00