我们最新版本的biolinux已经安装好了 MCScanX 在/biosoft目录下;你下载最新的biolinux ova包重新导入就好:https://www.omicsclass.com/article/496 linux基础不好可以观看视频课程: 《linux系统使用》
回答于 2018-12-03 15:40
可以了解一下什么是tandem duplication和segmental duplication : https://www.omicsclass.com/question/1
回答于 2018-12-03 12:45
这篇文章中有安装方法说明,错误解决也有,仔细查看:https://www.omicsclass.com/article/275
回答于 2018-12-03 10:22
MEME分析我们是在本地linux当中分析的,不需要下载xml,分析完成就已经生成xml文件, 可观看《基因家族分析实操课程》查看MEME分析使用
回答于 2018-12-03 09:45
MCScanX一般是做基因组之间的共线性,你9条序列做不了共线性。 你想找9条基因之间的关系,可先做不同物种的所有的共线性关系,然后看你的9条基因在不同物种之间是否存在共线性关系,也就是子集,可以类似做个这样的图: 共线性分析见:https://www.omicsclass.com/article/275
回答于 2018-12-03 09:42
python版本的jcvi分析参考:https://www.omicsclass.com/article/284 基础不好,建议学习《基因家族分析实操课程》,里面最后有这部分视频课程。
回答于 2018-11-28 16:07
你可以做一下MCScanX分析,然后把两两染色体的共线性结果挑出来,https://www.omicsclass.com/article/275 但是聚类没有做过,我不清楚
回答于 2018-11-28 16:05