omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
13823金币数
77620 经验值
428个粉丝
主页被访问 75515 次

3897 个回答

0 赞同

关于操作中遇到的Perl脚本。

目前我们课程里面涉及的脚本语言都是perl语言,没有考虑python,要想生信更进一般建议这两门语言都学习一下;学会了一门编程语言,学习另外一门编程语言也会轻松许多。 目前课程不会涉及python。后续我们也会出python的课程。 如果课程添加python脚本需要重新录制课程,所以目前没有这方面的计划; 更多生物信息perl...

回答于 2018-11-13 09:48

0 赞同

在NCBI上,新发表物种的基因组数据如何寻找并下载gff等文件

嗯,可以参考下面的文章:https://www.omicsclass.com/article/497 

回答于 2018-11-12 18:05

0 赞同

使用linux命令行下载Python出现错误

看你的报错也是新手,biolinux上已经有了python  没有必要不要自行安装,安装过程会很麻烦; 源码安装python,请确保每一步都正确完成,再进行下一步; 好多都是权限问题,你可以在命令前面加 sudo;

回答于 2018-11-12 13:31

0 赞同

我想问下,如果做小麦基因家族分析,分配给虚拟机Linux系统的运...

可参考这个:https://www.omicsclass.com/question/431 小麦基因组约17G  你最少分配80G以上的内存吧,具体没有测试过;  你可以试一下;

回答于 2018-11-11 16:10

0 赞同

请问小麦基因家族分析电脑内存小,提取的文件是空的,这个问题解...

1.检查染色体ID 对应关系,不对应可能造成提取失败 2.小麦基因组巨大,在基因组上截取序列需要读入整个基因组,需要消耗很多电脑内存,如果电脑内存不足也会提取失败,因此,建议分染色体做:https://www.omicsclass.com/question/431  , 或者升级电脑内存;

回答于 2018-11-09 11:58

0 赞同

circos图配置文件整理疑问

如果是要绘制基因家族共线性分析,类似下图,可将你截图中的<rules> </rules>之间的内容删除: 如果不删除就会得到下图结果,1号染色体和2号染色体条带颜色,4,5号染色体之间的条带颜色不一样:

回答于 2018-11-09 09:17

0 赞同

在共线性分析的串联重复时,标黑的脚本报错,我将路径都成我自己...

输入文件的路径文件名都检查一遍,看看都存在或者写的对不。

回答于 2018-11-08 21:29

0 赞同

老师,我的Fibonacci数据用for循环运行不出来,找不到原因,麻烦...

不好意思,脚本文件可能上传错了,已经更新,只需要吧这两个地方改一下,就好; 

回答于 2018-11-08 18:11

0 赞同

MCSCANX共线性图代码报错

注意空格:

回答于 2018-11-08 13:35

0 赞同

相近功能基因的检索方法的具体操作???

已知功能的基因库,例如NR库,将自己的基因序列与NR库比对(blastp),比对上的基因具有什么功能,那么我的基因也相似的功能。 NCBI上的blast工具就可以实现。

回答于 2018-11-08 11:28