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系统发育树:基因结构比较散，长度差异大，如何绘制满意的系统发...
应该是序列差异太大，可以删除一些大的gap，或者删除一些差异大的基因： https://www.omicsclass.com/article/221 如果基因全长序列差异太大，建议截取结构域所在序列构建进化树； 如果要编辑MEGA输出的多序列比对结果建议用genedoc：https://www.omicsclass.com/article/502
回答于 2018-10-27 07:15
老师好，我在做进化树的时候报错
应该是序列差异太大，可以删除一些大的gap，或者删除一些差异大的基因： https://www.omicsclass.com/article/221 如果基因全长序列差异太大，建议截取结构域所在序列构建进化树；
回答于 2018-10-24 17:42
热图中基因名称的显示
应该是heatmapper吧，刚刚用了下，原来是输入文件左上角，必须是NAME才行，不然是数字； http://www.heatmapper.ca/expression/
回答于 2018-10-23 18:59
用perl脚本提取顺势作用元件的序列是显示zsh: killed ，是因为内...
是小麦的基因组吗？小麦基因组巨大，看你的内存总共4G，一下子读入内存肯定不行； 我们的脚本是把参考基因组一下子都读进内存的，如果参考基因组文件太大，就会内存不足； 建议用get_fa_by_id.pl脚本把参考基因组分隔成不同的染色体，然后分染色体提取序列；最后 合并结果；
回答于 2018-10-23 13:00
在转录组中找糖苷酶基因
有参转录组：应该有基因组，如果基因组是JGI或者ensembl上的，可以直接搜索基因功能的关键字，参考：https://www.omicsclass.com/article/50 或者 https://www.omicsclass.com/article/58 再有就是基因组完成，一般会对基因的功能进行注释，会有一部分注释信息在gff文件里面你可以下载下来看看。
回答于 2018-10-22 10:49