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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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3895 个回答

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各位老师,请问一下DEseq2差异基因分析所用得到数据是expected_c...

DEseq2做差异分析应该用count值,不要用fpkm值。

回答于 2018-10-02 19:20

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老师,我在学习基因家族视频,用perl脚本get_gene_weizhi预测基...

提取不出序列,你看看你基因的位置信息里面的第一列里面的序列ID,和你基因组的序列id是不是对应,搜索检查一下;

回答于 2018-10-02 19:19

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在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的?...

可以参照这些方法查找:https://www.omicsclass.com/question/268

回答于 2018-10-02 19:15

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请问怎么把保守结构域和进化树画在一张图

可参照这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/382

回答于 2018-10-02 19:13

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关于转录组发表sci

基因组没有发布,你写文章方法的时候,没法写我的数据比对到哪个基因组?  无法引用,审稿人肯定会问你的; 建议:如果着急发,可以按无参转录组来分析,写文章。

回答于 2018-09-30 10:11

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老师您好,我想比较蝶形花亚科物种的叶绿体基因组,由于已经发表...

建议你找篇类似的文献阅读一下,看看别人怎么比较,自己得有个研究思路;我这边没有做过类似的,比较; 如果做不同物种叶绿体进化树可以参考:https://www.omicsclass.com/article/226

回答于 2018-09-30 10:08

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老师,您好,我的物种没有基因的染色体位置信息,用get_gene_wei...

请将问题说明白,我这才好给你分析原因,因为每个人输入的文件都有差异,你不给我看,我这猜测怎么解决问题呢? 参考一下别人怎么 提交问题:https://www.omicsclass.com/question/242

回答于 2018-09-30 10:05

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拟南芥UVR8有7个RCC1蛋白保守结构域,在之前一些文献的图片中也...

哪种图?不明白你的问题,请详细说明。 参考:https://www.omicsclass.com/article/82

回答于 2018-09-29 22:56

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java -version不是内部命令或外部命令或批处理文件

1.查看一下:D:\Program Files\Java\jdk-11\bin  这个目录存在不存在; 2.PATH最后 这个 ;  添加上. 3.参考java的环境配置方法:https://www.omicsclass.com/article/298

回答于 2018-09-29 10:31

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基因家族成员,筛选差异表达基因

1.公开数据查找可到NCBI上的SRA数据库里面搜索二代测序的转录组数据 2.搜索到数据就可以做一下转录组分析,就可以做一下转录组分析,这部分分析比较麻烦,由于数据量比较大。初学者不好分析; 如果要自己分析以上内容建议学习课程:《转录组数据分析后挖掘》《转录组数据分析》《有参转录组结果解读课程》  如果自己不...

回答于 2018-09-28 19:59