A contig is a contiguous length of genomic sequence.A scaffold is composed of contigs and gaps. Gap length can be guessed by incorporating information from paired ends or mate pairs What is a Scaffold?A scaffold is a portion of the genome sequence reconstructed from end-sequenced whole-genome shotg...
回答于 2018-09-20 09:52
你上图中的命名规则我不是很清楚,你不需要理解别人的命名规则, 你要理解自己的数据,基因的信息都记录在基因组的gff文件里面,你仔细看一下gff文件内容,包括基因的位置信息,基因的ID,基因的转录本ID等等信息都有的; GFF3文件说明:https://www.omicsclass.com/article/306 看你截图的文件是gtf格式,这个格式的文...
回答于 2018-09-20 09:43
默认没有行注释的快捷键,要自行添加 我用的3.12,在“工具-首选项”,分类里选“工具--键盘”,类型选“编辑”,命令找到“行注释”,在“按下新的快捷键”里按下键盘即可,之后点“分配”。 命令里还有“取消行注释”(仔细找,命令实在是很多),也可以设个快捷键。不过这个不能和“行注释”相同。 同样的方法也可以设...
回答于 2018-09-19 20:25
在word里面,插入符合对话框中,“字体times and new roman”,子集“广义标点”里面也可以找到。
回答于 2018-09-19 18:15
批量引物设计,可以使用primer3完成,这里有个类似的脚本可完成:https://www.omicsclass.com/article/195 如果只是几十个,在线的primer3web也可以手动一个一个的完成:http://primer3.ut.ee/ 或者DNAMAN手动设计引物也是可以的; 如果有成千上万的引物需要设计可观看视频里面有引物设计脚本编写流程:perl高级编程课程
回答于 2018-09-19 09:08
上面提到的方法,只能给出一个hubgene,可参考这个得到多个hub基因:https://www.omicsclass.com/article/381
回答于 2018-09-18 18:32
你检查一下你的输入文件,是否正确,包括格式,ID是否对应等等; 具体你可以把代码,输入文件,部分截图。我好查看错误原因,请修改一下问题,提供更详细的信息。参考别人的提问:https://www.omicsclass.com/question/242 点击编辑就可以重新编写问题了:
回答于 2018-09-18 10:20
进化树分析出来一般有个文件,nwk格式的,调整美化(圆形,方形等等)可以参照iTOL使用:https://www.omicsclass.com/article/417 划分亚组,可以根据进化树分支的情况,聚类较近的可以分一个亚家族。
回答于 2018-09-18 10:16