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变异结果过滤
这个我不知道你的测序深度，还有物种基因组大小，还有你过滤的参数；不好评估SNP数量上的多少是否合理。 建议多尝试过滤参数，在质量和数量上取一个平衡；符合自己的预期即可；
回答于 2024-02-22 15:30
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老师，我前面问的那个nohup命令很快就结束，您让我用file查看gz...
看了你的问题，你看看视频里面输入的是gz压缩的文件吗？不是的话可以解压一下再输入，批量解压文件：gunzip *gz
回答于 2024-02-21 09:55
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用samtools call出单个样本的rawvcf文件，合并之后发现samtools...
samtools 结合 bcftools call SNP； 建议你用我嘛课程里面GATK流程吧，比较主流；
回答于 2024-02-20 14:41
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请问出现以下情况是什么错误呢
显示你的服务器账号的存储不够了，把多余的数据删除一些吧：disk exceed；容器没有启动成功； 共享服务器只做练习使用；分析自己的数据可以购买我们的服务器：https://study.omicsclass.com/index
回答于 2024-02-20 10:14
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将自己windows中D盘的数据映射到docker中的work目录时格式一直有...
你登录了服务器，服务器上是没有D盘的；你需要用filezilla 把D盘的数据上传到服务器才行； 服务器上用这条命令是对的：
回答于 2024-02-19 17:30
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老师，我有30个经过高氮、低氮处理的转录组数据，但是不清楚我的...
对的可以这么设置dummy变量：https://www.omicsclass.com/article/2390 但是你这个每一个分组样本只有三个，效果不一定好；
回答于 2024-02-19 10:05
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