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Meme搜索蛋白motif网页结果显示与TB-tools打开.xlm文件的不一致

以前没有遇到这个现象,检查下html的结果,是不是弄错了?   输入的文件弄混了

回答于 2018-09-10 21:47

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计算基因kaks时,axt文件序列末尾已删除多余和gap,但运行命令时...

可以参考这篇文章解决办法:https://www.omicsclass.com/article/700

回答于 2018-09-10 16:35

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基因家族鉴定

一般来说公开的物种的基因组序列,都有注释的,都可以从基因组网站下载到该物种所有基因的cds和PEP序列; 如果你自己组装的基因组,需要对基因组进行注释,就可以得到基因组的所有基因序列(CDS和PEP);接着就可以继续往下分析了;

回答于 2018-09-10 16:31

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进化树序列名称如何更改

29767.m000208  这个是你的基因ID。你的截图中的ID,是作者对鉴定出来WRKY基因家族的基因重新编的号; 你也可以自己重新编号一下自己鉴定出来的某类基因家族;

回答于 2018-09-10 11:56

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我是新手,想问问各位前辈怎么下载水稻和拟南芥的SBP基因家族,...

可以通过基因组网站搜索,然后批量下载相关基因,参照JGI:https://www.omicsclass.com/article/50

回答于 2018-09-06 10:19

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提取上游1500bp报错Bad end parameter (4488)且输出结果不全

你得看看你的基因的位置在scaffold的什么地方,基因位置如果太靠近scaffold的开始,那么基因的前面就不足1500bp的序列供提取上游1500bp的序列,所以没有提取成功; 另外,你也说了你的scaffold总长才:1687bp,再加上基因的长度,哪里还能提出基因上游的1500bp?

回答于 2018-09-05 19:13

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biolinux中的root密码是多少呢,我在var下创建data文件夹的时候...

biolinux用户密码: 用户:manager密码:manager 用户:root密码:manager 更多关于biolinux见:https://www.omicsclass.com/article/169

回答于 2018-09-05 14:02

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《基因家族分析》get_gene_weizhi.pl和get_gene_gff.pl运行结果...

get_gene_weizhi.pl这个脚本你可以修改一下,参考:https://www.omicsclass.com/article/175 get_gene_gff.pl 脚本代码我忘记了,应该也是类似的修改; 建议学习一下perl语言:生物信息perl语言学习视频课程:《perl入门》《perl高级编程》

回答于 2018-09-05 10:36

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样品编号需要注意那些问题?

样品编号命名应该规范,在送样之前就应该考虑好样品的命名,做到命名清晰明了。 为方便计算机分析处理数据,这里总结一下命名方法: 1.样品命名做到:英文字母+数字组成;可以用下划线“_ -”作为分隔符; 2.样品命名不要纯数字 3.样品命名中不要出现中文 4.样品命名不要有特殊字符如:“!@#¥%$&*)(+=” 等等 5.命...

回答于 2018-09-05 10:28

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在使用组学大讲堂中介绍的方法计算Kaks时,系统结果生成的文件里...

没有报错信息吗?  没有报错信息我这也看不出来, 检查你输入的文件是否有问题?

回答于 2018-09-05 10:06