以前没有遇到这个现象,检查下html的结果,是不是弄错了? 输入的文件弄混了
回答于 2018-09-10 21:47
可以参考这篇文章解决办法:https://www.omicsclass.com/article/700
回答于 2018-09-10 16:35
一般来说公开的物种的基因组序列,都有注释的,都可以从基因组网站下载到该物种所有基因的cds和PEP序列; 如果你自己组装的基因组,需要对基因组进行注释,就可以得到基因组的所有基因序列(CDS和PEP);接着就可以继续往下分析了;
回答于 2018-09-10 16:31
29767.m000208 这个是你的基因ID。你的截图中的ID,是作者对鉴定出来WRKY基因家族的基因重新编的号; 你也可以自己重新编号一下自己鉴定出来的某类基因家族;
回答于 2018-09-10 11:56
可以通过基因组网站搜索,然后批量下载相关基因,参照JGI:https://www.omicsclass.com/article/50
回答于 2018-09-06 10:19
你得看看你的基因的位置在scaffold的什么地方,基因位置如果太靠近scaffold的开始,那么基因的前面就不足1500bp的序列供提取上游1500bp的序列,所以没有提取成功; 另外,你也说了你的scaffold总长才:1687bp,再加上基因的长度,哪里还能提出基因上游的1500bp?
回答于 2018-09-05 19:13
biolinux用户密码: 用户:manager密码:manager 用户:root密码:manager 更多关于biolinux见:https://www.omicsclass.com/article/169
回答于 2018-09-05 14:02
get_gene_weizhi.pl这个脚本你可以修改一下,参考:https://www.omicsclass.com/article/175 get_gene_gff.pl 脚本代码我忘记了,应该也是类似的修改; 建议学习一下perl语言:生物信息perl语言学习视频课程:《perl入门》《perl高级编程》
回答于 2018-09-05 10:36
样品编号命名应该规范,在送样之前就应该考虑好样品的命名,做到命名清晰明了。 为方便计算机分析处理数据,这里总结一下命名方法: 1.样品命名做到:英文字母+数字组成;可以用下划线“_ -”作为分隔符; 2.样品命名不要纯数字 3.样品命名中不要出现中文 4.样品命名不要有特殊字符如:“!@#¥%$&*)(+=” 等等 5.命...
回答于 2018-09-05 10:28