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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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在singularity中复现遗传进化中数据过滤时出现以下信息导致clean...

建议使用我们提供的docker 方法运行,避免软件安装问题导致报错; 群体遗传进化镜像已经更新2.0 :https://www.omicsclass.com/article/2286 建议使用最新的镜像转换singularity 试试:https://www.omicsclass.com/article/1885

回答于 2024-03-04 18:24

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求助,进入docker数据分析是设置共享文件出现问题

不是数字 11 是英文的 小写LL,你试试的; linux基础应该学习一下:https://bdtcd.xetslk.com/s/17gwqZ

回答于 2024-03-04 09:27

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WGCNA分析生成的单个模块txt文件非常大,请问老师有没有什么好的...

使用linux 命令 less就可以直接打开; windows使用:pilotedit(http://www.pilotedit.com/) 对的改成自己的文件名字;

回答于 2024-03-04 09:25

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16s分析导入数据遇到同样的问题,请问您解决了吗?

这个shell变量是不是没有 export设置正确,再看看视频吧:datadir

回答于 2024-03-04 09:23

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二代数据质控

可以截图看看的,没看到图不好说; 只能说双峰就是污染;

回答于 2024-03-04 09:21

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重测序circos运行失败

你的基因组组装到染色体了吗? 没有组装到染色体会有很多scaffold,把那些短scaffold多删除一些,试试;

回答于 2024-03-04 09:17

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重测序比对

这个只是标识,对数据分析没有影响,简单可以写 BGI

回答于 2024-03-01 10:14

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WGCNA中过滤低表达量(0.5)时datExpr0=datExpr0[1:n,datExpr0[n...

代码么有错的话,可能是你过滤的太严格了,放低这个值试试:meanFPKM

回答于 2024-03-01 10:02

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利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树mcmctree

避免软件安装问题,可以使用我们组学大讲堂提供的docker镜像,及视频课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/24yiRs 不同linux系统软件安装会有不同的报错,这边不好回答

回答于 2024-03-01 10:00

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rJava 安装包错

解决办法: export JAVA_HOME=/share/work/biosoft/java/latest/ 再安装 rJava包

回答于 2024-02-29 16:11