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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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构建好的进化树怎么进行结果分析那?谢谢!

不同的基因家族分类方法不一样,可以多看看文献看一下自己的这个基因家族在别的物种中怎么分析的,找找分析思路; https://www.omicsclass.com/article/459  一些基因家族文章;

回答于 2018-10-08 10:35

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基因家族分析提取启动子序列出现问题,望老师解答

请仔细观看视频,这个脚本不是这么用的:

回答于 2018-10-08 10:32

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拟南芥UVR8有7个RCC1蛋白保守结构域,在之前一些文献的图片中可...

这个具体的结构域你得弄清楚,可能你的基因序列本身就没有连续的,自然就出不来那个图了; 或者你可以试一下选择 full result 显示试一下:https://www.omicsclass.com/article/310  

回答于 2018-10-04 10:56

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各位老师,请问一下DEseq2差异基因分析所用得到数据是expected_c...

DEseq2做差异分析应该用count值,不要用fpkm值。

回答于 2018-10-02 19:20

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老师,我在学习基因家族视频,用perl脚本get_gene_weizhi预测基...

提取不出序列,你看看你基因的位置信息里面的第一列里面的序列ID,和你基因组的序列id是不是对应,搜索检查一下;

回答于 2018-10-02 19:19

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在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的?...

可以参照这些方法查找:https://www.omicsclass.com/question/268

回答于 2018-10-02 19:15

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请问怎么把保守结构域和进化树画在一张图

可参照这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/382

回答于 2018-10-02 19:13

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关于转录组发表sci

基因组没有发布,你写文章方法的时候,没法写我的数据比对到哪个基因组?  无法引用,审稿人肯定会问你的; 建议:如果着急发,可以按无参转录组来分析,写文章。

回答于 2018-09-30 10:11

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老师您好,我想比较蝶形花亚科物种的叶绿体基因组,由于已经发表...

建议你找篇类似的文献阅读一下,看看别人怎么比较,自己得有个研究思路;我这边没有做过类似的,比较; 如果做不同物种叶绿体进化树可以参考:https://www.omicsclass.com/article/226

回答于 2018-09-30 10:08

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老师,您好,我的物种没有基因的染色体位置信息,用get_gene_wei...

请将问题说明白,我这才好给你分析原因,因为每个人输入的文件都有差异,你不给我看,我这猜测怎么解决问题呢? 参考一下别人怎么 提交问题:https://www.omicsclass.com/question/242

回答于 2018-09-30 10:05