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老师，就是我把重测序个体分为三组进行SNP扫描，然后把三次扫描...
样本多建议每个样本先生成GVCF，再合并。 你贴的haplotypecaller命令生成的是VCF不是GVCF，下面的代码合并会会报错： 大样本 call SNP 生成GVCF这部分内容重测序课程里面有，你看看的：点击学习：https://bdtcd.xetlk.com/s/1VQOjQ
回答于 2024-11-29 07:19
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老师您好，我们在水稻泛基因组数据库https://ricerc.sicau.edu.c...
是不是fa格式你可以打开文件看看的；linux里面用less打开文件； fasta 也是文本文件，windows 打开文件：https://www.omicsclass.com/question/42 fasta格式定义：https://zh.wikipedia.org/wiki/FASTA%E6%A0%BC%E5%BC%8F 如果是fasta格式就可以分析；
回答于 2024-11-26 13:48
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重测序文件中的data data 文件打不开
linux不支持图形显示，要查看文件可以用filezilla下载到本地查看文件； 或者用linux less 查看文件
回答于 2024-11-25 14:11