omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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群体遗传进化中合并候选基因区间失败，文件是bed格式，麻烦老师...

新版的bedtools 不能有表头，你把文件的表头去掉试试的；

回答于 2024-01-08 12:03

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你这个vcf有的行没有这个参数，所以有提示，你看VCF文件吧；

回答于 2024-01-07 21:35

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你的GFF文件问题吧，这个网站没有UTR信息会自动把cds当作exon；你检查你的GFF文件格式问题

回答于 2024-01-07 21:34

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R脚本只是绘图，输入的就是nwk文件；你用nwk文件到 ITOL或者evolview在线网站手动编辑美化进化树吧：https://www.omicsclass.com/article/963

回答于 2024-01-07 21:32

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观察你的数据吧，不同的数据测序深度不一样，需要根据实际情况调整，过滤没了，建议降低过滤标准；

回答于 2024-01-07 21:31

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检查输入文件是否有问题，重点FAI文件染色体明着pvalue文件染色体是否一致

回答于 2024-01-07 21:30

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admixture 分析没有正确完成吧，有些文件没有生成，你检查检查的；

回答于 2024-01-06 23:49

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建议用我们提供的docker镜像，比较基因组镜像里面安装了这个软件；

回答于 2024-01-06 11:09

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检查软件参数是否前后一致，

回答于 2024-01-06 11:08

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命令行写错了吧，你检查输入文件和命令行，指导的分组列名在不在你的分组文件里面

回答于 2024-01-06 11:06