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3849 个回答

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老师我对多个品种叶片重测序,并调查表型 油脂含量,做GWAS关联...

一年的数据也可以做关联分析的;

回答于 2023-12-18 09:27

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基因家族2.0数据准备,跑完代码后生成新的gff文件会加一列新的id

么有加,你核对一下数据的,在最初的GFF里面搜索一下有没有这个ID的基因;

回答于 2023-12-18 09:26

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一次搜索多个结构域

多个hmm文件可以cat一起,一起输入hmmsearch搜索多个的。 但是,新手建议分开搜索再合并

回答于 2023-12-16 22:29

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在建立索引时出错,输出文件都是0KB

显示killed,数据量大,需要电脑内存足够才行,不然系统会自动杀死:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-12-16 22:28

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非模式物种功能注释与GO KEGG富集分析遇到问题

这个脚本会自动对gff文件排序等整理,你看看所有的染色体ID有没有少即可; 你打开gff文件搜索检查一下看看

回答于 2023-12-15 09:50

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在NCBI网站上,同一个SAMN具有多个SRR文件,获得的fastq文件合并...

文件合并看看这里:https://www.omicsclass.com/question/6317

回答于 2023-12-15 09:48

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circos作图

看看这里:https://www.omicsclass.com/article/644 删除0号对应的行即可:

回答于 2023-12-15 09:46

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kaks结果显示NA是什么含义

有些基因对差异比较大吧,计算不了 

回答于 2023-12-14 20:37

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种间共线性

这个看自己的分析目的了,每个研究者探讨的问题不同选的物种也不一样

回答于 2023-12-14 20:37

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call snp

任务快慢与否不仅和内存有关,还和CPU性能有关,如果有大量数据读写还和硬盘读写速度有关; xmx只是限制最大使用内存,并不是程序真正使用内存; 这一步gvcf内存对速度影响不大

回答于 2023-12-13 20:22