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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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3849 个回答

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基因家族数据准备运行错误

GFF文件不标准,有错误导致脚本出错, 是NCBI上的GFF文件吗?如果是可能需要手动修改就错才行;

回答于 2023-12-02 19:52

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求助老师,转录组分析定量没有双端reads比对上是怎么回事

你比对的有问题吧,比检查是不是前面的比对命令写错 了

回答于 2023-12-02 19:51

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SNP过滤问题

这个参数 过滤的时候慎重,一般不过滤:--minGQ 80

回答于 2023-12-02 19:49

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老师,这怎么解决

存储不够了,df -h 看一下

回答于 2023-12-02 19:48

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老师,pull镜像的时候,只要出现最后一行unauthorized 这一行后...

慢慢等吧我看还有很多waiting 等着下呢。如果购买我们课程,凭订单号可以找qq群管理员要百度网盘本地镜像给你

回答于 2023-12-01 21:31

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系统发育树

需要这个物种的基因组信息,和参考基因组比对一下找出SNP;合并进你这个VCF中;

回答于 2023-12-01 17:26

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请问这个问题怎么解决呀,谢谢

docker 没有安装好吧,服务没有启动吧:https://docs.docker.com/engine/install/centos/

回答于 2023-11-30 21:14

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fastq.gz文件合并

对的,可以的,直接cat也行,速度快: cat filename1.R1.fastq.gz  filename2.R1.fastq.gz  > filename.R1.fastq.gzcat filename1.R2.fastq.gz  filename2.R2.fastq.gz  > filename.R2.fastq.gz

回答于 2023-11-30 17:19

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老师您好,我下载的omicsclass/reseq:v1.1里没找到ParaFly脚本呢...

这个镜像更新了,你看看sh开头说明: https://www.omicsclass.com/article/2307

回答于 2023-11-30 16:05

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MCSCANX查看染色体的时候编号这么多那输出得ctl文件应该怎么设置

第一列染色体编号对吗? 没有组装到染色体的基因组不建议做这个分析;

回答于 2023-11-29 15:29