omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
13659金币数
76780 经验值
419个粉丝
主页被访问 72539 次

3849 个回答

0 赞同

core_pan_gene_curve.r 运行时报错

你的输入文件和示例文件再对比对比看看有啥异常没有;

回答于 2023-11-06 13:12

0 赞同

老师,请教一下下载的参考基因组染色体名字不一样,有什么办法改...

用sed 搜索替换一下就可以; 例如: sed -e "s/chr1/DD_chr1/" -e "s/chr2/DD_chr2/"  -e "s/chr3/DD_chr3/"  genome.fa >geneome.new.fa

回答于 2023-11-06 12:07

1 赞同

老师,求助,转录组差异表达基因分析报错

missing values in 'row.names' are not allowed 有文件的第一列有问题,你检查检查的;

回答于 2023-11-06 12:06

0 赞同

老师,求助,转录组差异表达基因分析报错-只有pfd文件没有PNG文...

绘图失败了,你这个 输入文件都检查一下看看的,文件之间的ID是否一致

回答于 2023-11-06 12:04

0 赞同

dadi 分析中根据基因组创建annovar库出现报错

基因组文件格式问题,你需要看看这个基因是否有异常;

回答于 2023-11-03 10:23

0 赞同

没有 easySFS.py

刚刚试了下是有的,注意自己用的镜像版本 请更新镜像到v2.0 才有:https://www.omicsclass.com/article/2286 

回答于 2023-11-03 10:20

0 赞同

重测序annovar注释

对的下载水稻的参考基因组,自己构建ANNOVAR的注释库才行,可以看看这个课程有视频课程:https://bdtcd.xet.tech/s/1VQOjQ

回答于 2023-11-02 23:12

0 赞同

请问老师,使用循环导致FORMAT后 样品名字识别错误 无法合并gvcf...

那是你的 生成bam文件的命令行写错了,才出现这个问题,你没有贴命令行,我也不知道你怎么写错了;

回答于 2023-11-02 23:11

0 赞同

新新新手提问!文件是Excle格式,怎么用R语言做进化树加热图呢?...

这个你可以看看这个扩增子分析课程里面有进化树分析才行:https://bdtcd.xet.tech/s/qZRiF

回答于 2023-11-02 23:09

0 赞同

老师,请帮忙,感谢。结果有参转录组5.deg报错。

你这个不要用记事本编辑文件,可能由于windows和linux文件编码不兼容带来不必要的报错,建议用专业的文本编辑器编辑文件: https://www.omicsclass.com/article/395 并且统一编码 UTF-8

回答于 2023-11-02 09:58