可以到一下基因组数据库查找下载:https://www.omicsclass.com/article/58 https://www.omicsclass.com/article/50
回答于 2023-10-31 08:32
用的是示例数据吗? 如果不是,自己的数据大,需要更多内存,这个可以设置一下:-Xmx5G 如果是windows中运行docker需要设置内存:https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2023-10-31 08:29
可以,但是 你需要把要用到的软件都安装一下,并且添加到环境变量中,设置配置好; 有了docker就不用配置软件环境了;
回答于 2023-10-31 08:27
看看这个同样的问题:https://www.omicsclass.com/question/4971 加下可执行权限,那些脚本cd $scriptdir && chmod a+x *
回答于 2023-10-30 13:40
看看 $FAI 文件里面的 染色体ID和你的 all.chr.xpclr 染色体ID是否一致; 还有就是 19226500 这个值表示小于这个长度的染色体会被过滤掉;
回答于 2023-10-26 12:28
nohup vcftools --gzvcf rice.raw.vcf.gz --recode --recode-INFO-all \ --stdout --maf 0.05 --max-missing 0.9 --minDP 2 --maxDP 1000 \ --minQ 30 --minGQ 0 --min-alleles 2 --max-alleles 2 \ --remove-indels 2>vcftools.log| gzip - >myresult/nohup1.vcf.gz & 试试上面的这个命令,并且看看这...
回答于 2023-10-23 16:57